More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0521 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
928 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1072 aa  2224    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
1036 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1285 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  43.65 
 
 
1100 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
920 aa  479  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.08 
 
 
2017 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
1319 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  34.06 
 
 
1099 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.44 
 
 
1781 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32 
 
 
1781 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  30.96 
 
 
1406 aa  366  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.48 
 
 
439 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  60.2 
 
 
971 aa  360  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
715 aa  354  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.53 
 
 
1780 aa  353  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  44.42 
 
 
1901 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.22 
 
 
1313 aa  349  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
680 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 
594 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.73 
 
 
537 aa  327  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 
699 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.47 
 
 
688 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.77 
 
 
585 aa  314  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  44 
 
 
1850 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.71 
 
 
937 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
494 aa  312  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  55.76 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.44 
 
 
1797 aa  311  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52 
 
 
675 aa  309  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  54.26 
 
 
458 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
470 aa  308  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 
440 aa  307  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
1123 aa  307  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.58 
 
 
1804 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  52.36 
 
 
641 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45 
 
 
1808 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  53 
 
 
407 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 
431 aa  302  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  42.39 
 
 
1811 aa  301  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.96 
 
 
551 aa  301  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.09 
 
 
1794 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 
437 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  51.37 
 
 
468 aa  292  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.46 
 
 
1795 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
468 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 
1274 aa  288  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.93 
 
 
390 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  41.84 
 
 
468 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  50.49 
 
 
342 aa  281  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
443 aa  278  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.86 
 
 
1805 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  33.63 
 
 
1934 aa  273  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 
1942 aa  271  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.63 
 
 
437 aa  256  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
732 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
1021 aa  240  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
440 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  41.45 
 
 
708 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  41.1 
 
 
724 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  39.67 
 
 
730 aa  221  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 
1977 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
1146 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  42.25 
 
 
681 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
392 aa  217  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  38.98 
 
 
726 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
467 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
467 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
594 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
602 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
457 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  38.26 
 
 
715 aa  210  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
1183 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  41.03 
 
 
429 aa  209  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
683 aa  208  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  40.68 
 
 
505 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  40.07 
 
 
408 aa  208  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  40.07 
 
 
408 aa  208  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
1465 aa  207  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  38.36 
 
 
611 aa  207  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
611 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  39.27 
 
 
358 aa  206  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
611 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  36.68 
 
 
439 aa  204  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
553 aa  204  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
713 aa  204  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1074  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
433 aa  204  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.708962  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
678 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  38.54 
 
 
1187 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
470 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
589 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  38.68 
 
 
598 aa  199  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  37.41 
 
 
445 aa  199  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  38.51 
 
 
305 aa  199  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  38.81 
 
 
524 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
919 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
389 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  38.41 
 
 
389 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  38.41 
 
 
358 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
679 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>