More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2324 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  100 
 
 
765 aa  1518  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  91.13 
 
 
6109 aa  1072  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2322  YD repeat-containing protein  80.81 
 
 
730 aa  764  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505225  decreased coverage  0.0077157 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  29.21 
 
 
1485 aa  122  4e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  28.73 
 
 
2225 aa  111  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  28.85 
 
 
678 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  28.48 
 
 
2178 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 
1959 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.15 
 
 
2096 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  28.48 
 
 
765 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.06 
 
 
1271 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  28.3 
 
 
2221 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.87 
 
 
1576 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 
1917 aa  95.9  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  26.55 
 
 
2246 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27.8 
 
 
2224 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.35 
 
 
2224 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.35 
 
 
2224 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 
2486 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  26.64 
 
 
765 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  36.8 
 
 
2374 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.03 
 
 
1840 aa  92  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 
1942 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.77 
 
 
1614 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.68 
 
 
924 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.73 
 
 
1568 aa  87.8  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.36 
 
 
1572 aa  87  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  28.35 
 
 
2658 aa  86.7  1e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  29.06 
 
 
504 aa  87  1e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.5 
 
 
2349 aa  85.5  3e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 
2942 aa  85.1  5e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.73 
 
 
3027 aa  83.2  2e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.33 
 
 
1467 aa  82.8  2e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 
1669 aa  82.4  3e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.68 
 
 
1732 aa  80.9  9e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 
3073 aa  80.5  1e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.14 
 
 
482 aa  79.7  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  27.16 
 
 
2145 aa  78.6  4e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.64 
 
 
1348 aa  78.6  4e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  28.95 
 
 
561 aa  78.6  5e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 
474 aa  77.4  8e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 
1352 aa  77  1e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.99 
 
 
2149 aa  77  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 
451 aa  76.6  1e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 
3689 aa  76.6  2e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  30.57 
 
 
903 aa  75.1  4e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.1545e-07  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.71 
 
 
1508 aa  74.3  8e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 
867 aa  74.3  8e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.45 
 
 
1464 aa  74.3  8e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.95 
 
 
1489 aa  74.3  9e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.05 
 
 
2035 aa  73.9  9e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.86 
 
 
1600 aa  73.9  9e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 
866 aa  73.9  1e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  26.72 
 
 
2290 aa  73.6  1e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 
1531 aa  73.2  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  30.26 
 
 
400 aa  73.2  2e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.99 
 
 
1485 aa  72.8  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.23 
 
 
3193 aa  72  3e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.08 
 
 
1586 aa  72  3e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.57 
 
 
1362 aa  72  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 
869 aa  72  4e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  34.25 
 
 
554 aa  72  4e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.56 
 
 
1381 aa  71.6  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.85 
 
 
1595 aa  72  4e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 
1400 aa  72  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  31.78 
 
 
382 aa  71.2  6e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  28.41 
 
 
396 aa  70.9  8e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 
1409 aa  70.9  8e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 
1411 aa  70.5  1e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.95 
 
 
1976 aa  70.5  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  28.41 
 
 
598 aa  69.7  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  31.49 
 
 
1488 aa  69.3  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  27.83 
 
 
2387 aa  69.7  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  26.24 
 
 
1639 aa  69.7  2e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 
2294 aa  68.9  3e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  27 
 
 
2076 aa  68.6  4e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1278  cell wall-associated protein  38.37 
 
 
258 aa  68.6  4e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406535  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  29.69 
 
 
788 aa  68.9  4e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  29.69 
 
 
788 aa  68.9  4e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  29.09 
 
 
741 aa  68.6  5e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 
480 aa  67.8  7e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  28.62 
 
 
705 aa  67.8  7e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.25 
 
 
1385 aa  67.4  9e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.28 
 
 
1599 aa  67  1e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.63 
 
 
1140 aa  67  1e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.05 
 
 
1008 aa  67  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.05 
 
 
1008 aa  67  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 
1550 aa  66.2  2e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 
1611 aa  66.2  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  28.03 
 
 
1053 aa  66.2  2e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  43.66 
 
 
520 aa  66.6  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  26.88 
 
 
1422 aa  65.9  3e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.35 
 
 
1527 aa  65.9  3e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  38 
 
 
1620 aa  65.5  4e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  34.95 
 
 
232 aa  65.1  5e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 
1147 aa  64.7  6e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  30.88 
 
 
889 aa  64.3  7e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.0197e-05  hitchhiker  3.45173e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  28.17 
 
 
1447 aa  64.3  7e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  22.33 
 
 
1517 aa  64.3  8e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  33.12 
 
 
357 aa  64.3  9e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>