More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3786 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
386 aa  723    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  95.6 
 
 
412 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  98.19 
 
 
386 aa  713    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  47.58 
 
 
440 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  48.16 
 
 
487 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  43.82 
 
 
478 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  47.52 
 
 
1987 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 
374 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  43.77 
 
 
456 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  42.7 
 
 
727 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.88 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
1755 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  46.76 
 
 
543 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 
544 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.83 
 
 
542 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.32 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.82 
 
 
637 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  51.63 
 
 
510 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
623 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  42.58 
 
 
490 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.53 
 
 
427 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  43.07 
 
 
1264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.65 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.86 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.42 
 
 
402 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.11 
 
 
506 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.57 
 
 
294 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.87 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.21 
 
 
429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
417 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  34.89 
 
 
570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  39.9 
 
 
540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 
401 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.82 
 
 
428 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  37.85 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.13 
 
 
322 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.94 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.99 
 
 
440 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 
375 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  44.5 
 
 
259 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.4 
 
 
510 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  40.96 
 
 
792 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  39.25 
 
 
671 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.93 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.3 
 
 
314 aa  90.5  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  46.39 
 
 
261 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  46.39 
 
 
261 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.09 
 
 
344 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.07 
 
 
388 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  51.58 
 
 
319 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
193 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.39 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.93 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.25 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.42 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.42 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.42 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 
537 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  41.59 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  41.59 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  41.59 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  41.59 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  41.59 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  41.59 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  36.89 
 
 
722 aa  86.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.42 
 
 
345 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.58 
 
 
337 aa  86.3  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.09 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 
221 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  46.59 
 
 
185 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.8 
 
 
216 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.09 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.09 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.42 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  41.59 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.39 
 
 
890 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.59 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.74 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
630 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.57 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.45 
 
 
670 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.9 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  41.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.87 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40.87 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40.87 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.74 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.88 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.87 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.87 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>