176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1175 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  100 
 
 		 593 aa  1221    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  26.92 
 
 		 609 aa  259  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  26.03 
 
 		 605 aa  246  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  29.01 
 
 		 611 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  26.45 
 
 		 592 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  28.53 
 
 		 606 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  27.39 
 
 		 606 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.16 
 
 		 612 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  28.18 
 
 		 612 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  26.74 
 
 		 606 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  27.07 
 
 		 606 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  28.18 
 
 		 612 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  28.18 
 
 		 612 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  28.18 
 
 		 612 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  27.41 
 
 		 612 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  27.51 
 
 		 612 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  28.71 
 
 		 616 aa  227  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  27.05 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  27.17 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  27.08 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  27.08 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  27.08 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  27.08 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  27.08 
 
 		 611 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  27.99 
 
 		 611 aa  220  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  26.97 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  26.81 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.81 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.86 
 
 		 590 aa  216  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  26.11 
 
 		 593 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.57 
 
 		 623 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  26.93 
 
 		 604 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  25.69 
 
 		 607 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  25.25 
 
 		 597 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  25.08 
 
 		 597 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  25.33 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  24.67 
 
 		 589 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  27.38 
 
 		 588 aa  193  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  25.59 
 
 		 629 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  25.83 
 
 		 629 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  26.7 
 
 		 606 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  26.6 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  26.15 
 
 		 588 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  24.75 
 
 		 597 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  26.4 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  27.02 
 
 		 608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  25.52 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  26.82 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  26.66 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  24.32 
 
 		 630 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  26.49 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.4 
 
 		 647 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  24.72 
 
 		 623 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  24.09 
 
 		 589 aa  180  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  23.52 
 
 		 586 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  23.91 
 
 		 626 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  26.07 
 
 		 588 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  26.16 
 
 		 587 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  23.75 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  23.75 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  25.36 
 
 		 616 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  25.36 
 
 		 616 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  25.36 
 
 		 616 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  23.75 
 
 		 626 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  24.88 
 
 		 629 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  24.88 
 
 		 623 aa  177  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  25.12 
 
 		 633 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  25.2 
 
 		 616 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  25.04 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  23.23 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  25.62 
 
 		 605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  25.62 
 
 		 605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  25.62 
 
 		 605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  24.6 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  24.96 
 
 		 633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  24.54 
 
 		 630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  24.14 
 
 		 626 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  23.7 
 
 		 629 aa  173  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  24.14 
 
 		 626 aa  173  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  24.14 
 
 		 626 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  24.14 
 
 		 626 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  25.74 
 
 		 624 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  26.23 
 
 		 589 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  23.47 
 
 		 660 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  24.1 
 
 		 588 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  25.51 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  24.44 
 
 		 623 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  24.2 
 
 		 582 aa  171  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  23.19 
 
 		 619 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  24.75 
 
 		 588 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  25.7 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  25.38 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  23.95 
 
 		 646 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  24.12 
 
 		 626 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>