175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3039 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  92.2 
 
 		 590 aa  1102    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 		 590 aa  1215    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  42.12 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  39.84 
 
 		 610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  39.52 
 
 		 606 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  39.03 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  39.13 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  38.55 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  37.82 
 
 		 611 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  37.5 
 
 		 611 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  37.66 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  37.02 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  37.34 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  37.34 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  37.34 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.69 
 
 		 605 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  37.62 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  38.06 
 
 		 611 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  36.29 
 
 		 612 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  36.29 
 
 		 612 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.32 
 
 		 612 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  36.29 
 
 		 612 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  36.29 
 
 		 612 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  36.48 
 
 		 619 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  36.17 
 
 		 612 aa  361  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  36.29 
 
 		 612 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  33.76 
 
 		 609 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  35.06 
 
 		 610 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.15 
 
 		 623 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  35.84 
 
 		 619 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  36.12 
 
 		 619 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  36.45 
 
 		 589 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  34.98 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  34.98 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  34.98 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  34.98 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  34.82 
 
 		 623 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  34.82 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  34.82 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  36.94 
 
 		 586 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  34.02 
 
 		 623 aa  336  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  33.55 
 
 		 623 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  35.7 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.95 
 
 		 592 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  33.18 
 
 		 625 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.43 
 
 		 593 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  34.44 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  32.45 
 
 		 628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  31.31 
 
 		 620 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.97 
 
 		 629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.81 
 
 		 626 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  32.84 
 
 		 597 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.12 
 
 		 624 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  33.88 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  32.35 
 
 		 597 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  33.55 
 
 		 589 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.29 
 
 		 629 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  31.55 
 
 		 626 aa  294  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  31.55 
 
 		 626 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  31.55 
 
 		 626 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  34.67 
 
 		 589 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.96 
 
 		 624 aa  293  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  29.35 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.07 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.77 
 
 		 630 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  33.28 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.18 
 
 		 629 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.87 
 
 		 629 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  30.82 
 
 		 582 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  30.6 
 
 		 626 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.95 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  31.16 
 
 		 582 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.95 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  33 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  32.6 
 
 		 629 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  30.44 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  30.43 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  29.95 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  30.44 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  32.44 
 
 		 629 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  33.22 
 
 		 588 aa  276  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  30 
 
 		 606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  30 
 
 		 606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  31.12 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  32.56 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  32.5 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  33.28 
 
 		 660 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  32.28 
 
 		 588 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  30.03 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  32.08 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  30.42 
 
 		 638 aa  269  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  30.6 
 
 		 630 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  32.27 
 
 		 620 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  30.46 
 
 		 629 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  31.02 
 
 		 627 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>