175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02049 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  57.91 
 
 
612 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  58.86 
 
 
616 aa  752    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  54.63 
 
 
610 aa  680    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  57.59 
 
 
612 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  57.91 
 
 
611 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  57.59 
 
 
612 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  58.4 
 
 
611 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  58.4 
 
 
611 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  58.08 
 
 
611 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  58.4 
 
 
611 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  58.24 
 
 
611 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  58.4 
 
 
611 aa  736    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  100 
 
 
611 aa  1241    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  57.42 
 
 
612 aa  706    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  57.42 
 
 
612 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  57.42 
 
 
612 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  57.59 
 
 
612 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  51.05 
 
 
660 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  50.08 
 
 
616 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  49.92 
 
 
616 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  49.92 
 
 
633 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  49.92 
 
 
616 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  49.92 
 
 
616 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  49.92 
 
 
633 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  46.45 
 
 
620 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  40.49 
 
 
611 aa  435  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  40.79 
 
 
646 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  38.97 
 
 
610 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  40.98 
 
 
605 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  40.98 
 
 
605 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  40.98 
 
 
605 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  38.36 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  38.19 
 
 
606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  38.03 
 
 
606 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  38.44 
 
 
603 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  38.05 
 
 
606 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  37.86 
 
 
606 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  37.95 
 
 
603 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.06 
 
 
590 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.5 
 
 
590 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.94 
 
 
605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  37.25 
 
 
589 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.13 
 
 
597 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  34.97 
 
 
597 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  35.42 
 
 
597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  32.01 
 
 
609 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  33.05 
 
 
589 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  34.09 
 
 
592 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  33.66 
 
 
625 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.31 
 
 
619 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  33.88 
 
 
619 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.71 
 
 
623 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  31.48 
 
 
586 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  31.34 
 
 
628 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.18 
 
 
588 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  33.97 
 
 
623 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  30.48 
 
 
611 aa  263  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.85 
 
 
588 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33.66 
 
 
587 aa  263  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  30.96 
 
 
588 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  33.71 
 
 
593 aa  262  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  31.83 
 
 
590 aa  260  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.24 
 
 
624 aa  257  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  33.55 
 
 
623 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.05 
 
 
630 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.43 
 
 
607 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.18 
 
 
588 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.48 
 
 
629 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  31.47 
 
 
582 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  31.55 
 
 
630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.79 
 
 
626 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  30.82 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  31.52 
 
 
582 aa  244  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  31.26 
 
 
623 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.27 
 
 
588 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.09 
 
 
588 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.64 
 
 
588 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  31.47 
 
 
589 aa  237  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.53 
 
 
629 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.06 
 
 
629 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.48 
 
 
624 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  32.15 
 
 
620 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  30.43 
 
 
627 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  30.27 
 
 
627 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  30.27 
 
 
627 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  31.99 
 
 
596 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  30.03 
 
 
588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  29.98 
 
 
626 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  29.98 
 
 
626 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  29.98 
 
 
626 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  29.98 
 
 
626 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  29.8 
 
 
587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.72 
 
 
629 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>