176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6046 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1202    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  43.46 
 
 		 592 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  40.43 
 
 		 605 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  36.93 
 
 		 606 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  36.75 
 
 		 610 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  36.93 
 
 		 606 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  36.6 
 
 		 606 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  36.7 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  34.8 
 
 		 609 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  36.14 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.59 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.21 
 
 		 590 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  34.73 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  34.73 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  34.73 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.93 
 
 		 612 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  34.41 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  35.28 
 
 		 612 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  27.61 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  35.28 
 
 		 612 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  34.57 
 
 		 611 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  35.28 
 
 		 612 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  35.12 
 
 		 612 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  34.57 
 
 		 611 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  35.12 
 
 		 612 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  35.06 
 
 		 611 aa  300  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  34.79 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  35.02 
 
 		 619 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.71 
 
 		 619 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  34.89 
 
 		 616 aa  291  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.27 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.71 
 
 		 611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  33.02 
 
 		 623 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  33.07 
 
 		 623 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  32.91 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  32.91 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  32.91 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  32.91 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  32.91 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  32.76 
 
 		 623 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  32.81 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  33.65 
 
 		 620 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  34.39 
 
 		 589 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  31.6 
 
 		 630 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.86 
 
 		 619 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.62 
 
 		 624 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  34.18 
 
 		 597 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  30.65 
 
 		 610 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.66 
 
 		 589 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  29.56 
 
 		 611 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  31.87 
 
 		 629 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  33.84 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  33.39 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  31.97 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  31.91 
 
 		 625 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.42 
 
 		 629 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  32.08 
 
 		 629 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  31.71 
 
 		 654 aa  257  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  29.5 
 
 		 628 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.13 
 
 		 587 aa  252  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.39 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  32.5 
 
 		 624 aa  248  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  31.85 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  32.08 
 
 		 629 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  32.02 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  32.02 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  32.02 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  32.08 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  32.02 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  32.08 
 
 		 629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  30.46 
 
 		 639 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.27 
 
 		 626 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  30.93 
 
 		 629 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.88 
 
 		 624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  28.96 
 
 		 629 aa  233  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  28.78 
 
 		 590 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.8 
 
 		 628 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  26.11 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  30.38 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  30.06 
 
 		 627 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  31.83 
 
 		 577 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  27.37 
 
 		 626 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  27.37 
 
 		 626 aa  225  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  27.37 
 
 		 626 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.08 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  30.77 
 
 		 576 aa  223  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  29.75 
 
 		 627 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  27.07 
 
 		 626 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.43 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  29.52 
 
 		 606 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  28.46 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  27.07 
 
 		 626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  27.07 
 
 		 626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  27.07 
 
 		 626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  28.85 
 
 		 595 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  27.75 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.34 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  28.89 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  26.53 
 
 		 582 aa  211  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  26.43 
 
 		 582 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>