176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6119 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  52.94 
 
 		 626 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  58.76 
 
 		 627 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  71.07 
 
 		 629 aa  931    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  100 
 
 		 629 aa  1288    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  70.91 
 
 		 629 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  58.28 
 
 		 626 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  70.91 
 
 		 629 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  69.75 
 
 		 629 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  69.9 
 
 		 629 aa  934    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  56.07 
 
 		 639 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  52.94 
 
 		 626 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  57.96 
 
 		 626 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  57.1 
 
 		 626 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  60.51 
 
 		 626 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  69.37 
 
 		 630 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  63.59 
 
 		 629 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  71.18 
 
 		 629 aa  952    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  52.94 
 
 		 626 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  71.07 
 
 		 629 aa  931    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  59.08 
 
 		 627 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  71.07 
 
 		 629 aa  931    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  58.92 
 
 		 627 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  52.06 
 
 		 637 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  58.21 
 
 		 626 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  71.07 
 
 		 629 aa  931    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  56.76 
 
 		 626 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  53.33 
 
 		 628 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  58.28 
 
 		 626 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  71.07 
 
 		 629 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  52.45 
 
 		 633 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  54.69 
 
 		 654 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  71.07 
 
 		 629 aa  931    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  50 
 
 		 642 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  44.82 
 
 		 623 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  44.53 
 
 		 623 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  44.37 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.68 
 
 		 623 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  43.81 
 
 		 620 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  41.1 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  40.03 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  42.48 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.73 
 
 		 624 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  40.63 
 
 		 624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  40.73 
 
 		 619 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  40.89 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  39.84 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.11 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  37.44 
 
 		 625 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  37.98 
 
 		 638 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.8 
 
 		 647 aa  290  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.57 
 
 		 652 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  30.95 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  30.35 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  31.24 
 
 		 611 aa  257  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  31.24 
 
 		 611 aa  257  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  31.24 
 
 		 611 aa  257  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  31.24 
 
 		 611 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.03 
 
 		 612 aa  256  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  31.08 
 
 		 611 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  31.08 
 
 		 611 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.24 
 
 		 590 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.71 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  28.95 
 
 		 606 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  29.43 
 
 		 610 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.43 
 
 		 611 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  31.58 
 
 		 621 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  30.85 
 
 		 589 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  28.79 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  28.17 
 
 		 606 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  28.95 
 
 		 606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  29.51 
 
 		 612 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  29.51 
 
 		 612 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  29.51 
 
 		 612 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  29.5 
 
 		 616 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  29.19 
 
 		 612 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  29.19 
 
 		 612 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  29.84 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  29.56 
 
 		 612 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  31 
 
 		 621 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  29.73 
 
 		 620 aa  228  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  28.96 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  29.02 
 
 		 597 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  27.17 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  28.46 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  25.94 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  28.48 
 
 		 597 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  26.88 
 
 		 607 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  25.62 
 
 		 609 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  28.1 
 
 		 597 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  25.86 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  27.98 
 
 		 586 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  25.55 
 
 		 588 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  27.4 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  26.36 
 
 		 614 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>