175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1604 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1244    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  99.52 
 
 
623 aa  1237    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  86.52 
 
 
623 aa  1101    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  95.35 
 
 
623 aa  1189    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  57.62 
 
 
623 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1244    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1244    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  99.36 
 
 
623 aa  1234    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  60.55 
 
 
620 aa  724    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  50 
 
 
628 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  99.68 
 
 
623 aa  1239    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1244    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  47.76 
 
 
624 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  48.88 
 
 
629 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  47.69 
 
 
629 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  47.7 
 
 
629 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  48.57 
 
 
629 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  49.6 
 
 
624 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  48.01 
 
 
624 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  47.53 
 
 
619 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  47.37 
 
 
619 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.28 
 
 
626 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  49.04 
 
 
629 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  46.42 
 
 
630 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  49.04 
 
 
629 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  48.89 
 
 
629 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  47.69 
 
 
619 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  48.89 
 
 
629 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  44.57 
 
 
626 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  48.89 
 
 
629 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  48.89 
 
 
629 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  44.57 
 
 
626 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  48.89 
 
 
629 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  44.57 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  44.57 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  45.53 
 
 
626 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  44.09 
 
 
626 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  44.37 
 
 
629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  45.06 
 
 
630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  44.98 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  44.82 
 
 
627 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  44.82 
 
 
627 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  44.73 
 
 
625 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  41.89 
 
 
626 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  41.89 
 
 
626 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  41.89 
 
 
626 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  42.97 
 
 
629 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  44.9 
 
 
638 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.47 
 
 
628 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  43.79 
 
 
654 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  43.56 
 
 
639 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  40.92 
 
 
637 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  39.09 
 
 
633 aa  439  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.06 
 
 
642 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.53 
 
 
652 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.81 
 
 
647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.98 
 
 
590 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.2 
 
 
590 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  35.04 
 
 
606 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  35.1 
 
 
641 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  34.47 
 
 
606 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  34.13 
 
 
610 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.38 
 
 
606 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  33.8 
 
 
606 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.46 
 
 
605 aa  317  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  35.22 
 
 
611 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  36.86 
 
 
597 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  37.28 
 
 
597 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  30.44 
 
 
609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  35.21 
 
 
597 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  34.15 
 
 
611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  33.93 
 
 
616 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  34.19 
 
 
589 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  33.82 
 
 
611 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  33.82 
 
 
611 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  33.66 
 
 
611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  33.66 
 
 
611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  33.66 
 
 
611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  35.43 
 
 
612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  35.43 
 
 
612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  35.27 
 
 
612 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  35.27 
 
 
612 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  35.06 
 
 
612 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  34.62 
 
 
612 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.5 
 
 
611 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  30.2 
 
 
607 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.14 
 
 
612 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  31.76 
 
 
589 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  29.75 
 
 
611 aa  264  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  33.02 
 
 
593 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  33.06 
 
 
586 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  36.28 
 
 
621 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  36.32 
 
 
621 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.55 
 
 
611 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  32.44 
 
 
588 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.96 
 
 
587 aa  252  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  34.98 
 
 
620 aa  252  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  33.17 
 
 
610 aa  250  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.76 
 
 
588 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  30.5 
 
 
588 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>