175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00261 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  53.6 
 
 		 619 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  100 
 
 		 625 aa  1268    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  53.44 
 
 		 619 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  52.64 
 
 		 619 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.31 
 
 		 623 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  45.53 
 
 		 623 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  44.89 
 
 		 623 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  45.37 
 
 		 623 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  44.89 
 
 		 623 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  44.73 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  44.73 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  44.73 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  44.57 
 
 		 623 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  44.73 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  44.67 
 
 		 620 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  42.81 
 
 		 628 aa  505  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.35 
 
 		 630 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.27 
 
 		 624 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  43.22 
 
 		 624 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  43.37 
 
 		 638 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  42.31 
 
 		 624 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  39.87 
 
 		 629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.27 
 
 		 626 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  40.13 
 
 		 626 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.49 
 
 		 629 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  39.24 
 
 		 626 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  39.24 
 
 		 626 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  39.24 
 
 		 626 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  39.24 
 
 		 626 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  39.84 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  38.77 
 
 		 626 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  39.53 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  39.53 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  39.12 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  39.53 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  39.53 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  39.53 
 
 		 629 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  39.53 
 
 		 629 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  39.53 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  37.76 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  37.4 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  37.4 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  37.4 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  38.54 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  38.54 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  37.44 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  38.38 
 
 		 627 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.35 
 
 		 647 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.25 
 
 		 628 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  37.6 
 
 		 654 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  36.39 
 
 		 629 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.66 
 
 		 652 aa  389  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  35.92 
 
 		 639 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.31 
 
 		 642 aa  362  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  34.96 
 
 		 637 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  35.01 
 
 		 633 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  36.33 
 
 		 611 aa  340  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  34.07 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.8 
 
 		 606 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  34.07 
 
 		 606 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  34.64 
 
 		 606 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  33.86 
 
 		 606 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  30.11 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.65 
 
 		 590 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.02 
 
 		 590 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.22 
 
 		 605 aa  296  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  33.39 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  33.39 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  33.39 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.66 
 
 		 611 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  32.91 
 
 		 611 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  32.91 
 
 		 611 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  32.91 
 
 		 611 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.74 
 
 		 612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.39 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  35.15 
 
 		 621 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  32.52 
 
 		 612 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  32.52 
 
 		 612 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  32.36 
 
 		 612 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  32.36 
 
 		 612 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  32.36 
 
 		 612 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.99 
 
 		 621 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  33.66 
 
 		 612 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  33.93 
 
 		 616 aa  277  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  34.73 
 
 		 620 aa  272  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  31.68 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  33.86 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  33.97 
 
 		 597 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  33.76 
 
 		 597 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  32.05 
 
 		 589 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.35 
 
 		 607 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  29.95 
 
 		 641 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  29.4 
 
 		 582 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  29.07 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  31.97 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  30.16 
 
 		 589 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  30.58 
 
 		 592 aa  238  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.24 
 
 		 593 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30 
 
 		 588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  27.9 
 
 		 611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>