176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2271 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  65.96 
 
 
606 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  66.12 
 
 
610 aa  873    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  65.96 
 
 
606 aa  859    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1260    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  65.79 
 
 
606 aa  858    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  66.12 
 
 
606 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  43.53 
 
 
616 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  42.11 
 
 
611 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  42.11 
 
 
611 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  42.11 
 
 
611 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  41.83 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  41.83 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  41.67 
 
 
611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  41.83 
 
 
611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.95 
 
 
612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  40.33 
 
 
610 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.12 
 
 
590 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  41.48 
 
 
590 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  40.49 
 
 
611 aa  435  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  40.91 
 
 
612 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  40.91 
 
 
612 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  40.75 
 
 
612 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  40.75 
 
 
612 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  40.75 
 
 
612 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  40.58 
 
 
612 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.98 
 
 
605 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.77 
 
 
623 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  36.39 
 
 
619 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  35.99 
 
 
589 aa  350  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  32.8 
 
 
609 aa  346  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  35.08 
 
 
619 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  35.98 
 
 
593 aa  343  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.76 
 
 
619 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  36.33 
 
 
625 aa  340  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  34.32 
 
 
628 aa  330  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  35.18 
 
 
586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.82 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.24 
 
 
597 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  35.38 
 
 
623 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  36.63 
 
 
587 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  35.38 
 
 
623 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.65 
 
 
630 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  33.49 
 
 
624 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  35.07 
 
 
597 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  35.74 
 
 
589 aa  317  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  35.19 
 
 
623 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  32.59 
 
 
607 aa  316  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  34.8 
 
 
623 aa  316  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  35.22 
 
 
623 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  35.22 
 
 
623 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  35.22 
 
 
623 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  35.22 
 
 
623 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  34.98 
 
 
620 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  34.13 
 
 
624 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  34.59 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  32.42 
 
 
590 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.76 
 
 
624 aa  301  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  34.08 
 
 
660 aa  299  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  35.24 
 
 
597 aa  297  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  33.81 
 
 
633 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  33.87 
 
 
616 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  33.81 
 
 
633 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  33.87 
 
 
616 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  33.87 
 
 
616 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.97 
 
 
629 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  33.87 
 
 
616 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  31.55 
 
 
626 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  31.55 
 
 
626 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  31.55 
 
 
626 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  33.06 
 
 
646 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.7 
 
 
629 aa  293  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  33.66 
 
 
605 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  34.24 
 
 
596 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  33.66 
 
 
605 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  33.66 
 
 
605 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.77 
 
 
626 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  33.06 
 
 
595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  30.44 
 
 
611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  32.52 
 
 
588 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  32.48 
 
 
589 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  32.25 
 
 
588 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.81 
 
 
629 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.81 
 
 
629 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  33.55 
 
 
595 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.81 
 
 
629 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  33.06 
 
 
588 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.65 
 
 
629 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  31.65 
 
 
629 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.65 
 
 
629 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  31.65 
 
 
629 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  32.03 
 
 
588 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  31.66 
 
 
582 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.88 
 
 
588 aa  277  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  30.51 
 
 
582 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.97 
 
 
629 aa  276  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  31.27 
 
 
626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  34.13 
 
 
595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  30.84 
 
 
626 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  31.77 
 
 
603 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  30.84 
 
 
626 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>