175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0248 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  60.82 
 
 		 627 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  54.94 
 
 		 626 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  57.78 
 
 		 628 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  99.68 
 
 		 629 aa  1260    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  54.94 
 
 		 626 aa  732    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  63.22 
 
 		 626 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  99.68 
 
 		 629 aa  1261    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  59.14 
 
 		 654 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  62 
 
 		 626 aa  783    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  76.08 
 
 		 629 aa  998    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  60.86 
 
 		 639 aa  755    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  61.53 
 
 		 626 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  62.74 
 
 		 626 aa  820    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  54.94 
 
 		 626 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  71.43 
 
 		 630 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  65.82 
 
 		 629 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  60.98 
 
 		 627 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  80.38 
 
 		 629 aa  1043    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  60.66 
 
 		 627 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  71.07 
 
 		 629 aa  937    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  99.68 
 
 		 629 aa  1260    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  53.09 
 
 		 633 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  53.91 
 
 		 637 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  99.68 
 
 		 629 aa  1260    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  65.23 
 
 		 626 aa  856    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  63.22 
 
 		 626 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  99.84 
 
 		 629 aa  1264    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  76.71 
 
 		 629 aa  995    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  63.22 
 
 		 626 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1266    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  75.2 
 
 		 629 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  99.68 
 
 		 629 aa  1260    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  53.08 
 
 		 642 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  48.89 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  48.89 
 
 		 623 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.59 
 
 		 623 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  48.89 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  48.89 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  48.89 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  48.73 
 
 		 623 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  48.73 
 
 		 623 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  48.41 
 
 		 623 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  46.75 
 
 		 623 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  47.85 
 
 		 620 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  44.34 
 
 		 628 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.31 
 
 		 624 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  44.29 
 
 		 624 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  44.13 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  45.25 
 
 		 619 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  44.94 
 
 		 619 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  45.18 
 
 		 619 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  43.3 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  43.55 
 
 		 638 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.16 
 
 		 630 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  39.53 
 
 		 625 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.93 
 
 		 652 aa  320  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.12 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.43 
 
 		 605 aa  294  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  32.18 
 
 		 611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  32.7 
 
 		 606 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  32.08 
 
 		 606 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  33.07 
 
 		 606 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  32.23 
 
 		 606 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  32.45 
 
 		 610 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.44 
 
 		 590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.86 
 
 		 590 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  34.63 
 
 		 621 aa  261  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  31.44 
 
 		 611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  31.28 
 
 		 611 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.6 
 
 		 612 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  31.44 
 
 		 611 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  31.44 
 
 		 611 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  31.44 
 
 		 611 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  31.28 
 
 		 611 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.63 
 
 		 621 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  33.69 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  31.82 
 
 		 612 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  31.88 
 
 		 616 aa  247  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  31.87 
 
 		 612 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  31.87 
 
 		 612 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 597 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.45 
 
 		 589 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  31.71 
 
 		 612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  31.71 
 
 		 612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.36 
 
 		 612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.65 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  31.97 
 
 		 597 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  30.79 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  32.38 
 
 		 597 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.5 
 
 		 593 aa  237  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.5 
 
 		 588 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.7 
 
 		 588 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  31.72 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.94 
 
 		 609 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.18 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  28.46 
 
 		 588 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  28.59 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  28.59 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  30.63 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  28.59 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>