176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2767 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  95.71 
 
 		 606 aa  1201    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  85.9 
 
 		 610 aa  1096    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  94.88 
 
 		 606 aa  1196    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  65.79 
 
 		 611 aa  858    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  100 
 
 		 606 aa  1254    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  95.05 
 
 		 606 aa  1194    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  39.77 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  39.71 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  39.71 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  39.71 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  39.61 
 
 		 611 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  39.61 
 
 		 611 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  39.45 
 
 		 611 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  39.45 
 
 		 616 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.6 
 
 		 612 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.55 
 
 		 590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  39.29 
 
 		 612 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  39.12 
 
 		 612 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  39.03 
 
 		 612 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  38.96 
 
 		 612 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  38.96 
 
 		 612 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  39.12 
 
 		 612 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  37.86 
 
 		 611 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.31 
 
 		 590 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  36.61 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  35.85 
 
 		 609 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.01 
 
 		 605 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  36.66 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.32 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  34.91 
 
 		 619 aa  336  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  34.54 
 
 		 619 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.07 
 
 		 619 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  34.19 
 
 		 589 aa  328  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  32.48 
 
 		 607 aa  326  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  33.75 
 
 		 628 aa  324  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  34.47 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.44 
 
 		 592 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  33.69 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  33.86 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  33.98 
 
 		 586 aa  308  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.39 
 
 		 623 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  32.47 
 
 		 590 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  32.49 
 
 		 620 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  32.81 
 
 		 624 aa  297  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.31 
 
 		 624 aa  295  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  34.3 
 
 		 587 aa  294  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  31.69 
 
 		 611 aa  293  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.79 
 
 		 624 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.06 
 
 		 630 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.45 
 
 		 629 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  33.39 
 
 		 589 aa  286  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.98 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  33.6 
 
 		 596 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  30.76 
 
 		 629 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  33.28 
 
 		 577 aa  280  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.36 
 
 		 629 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  31.98 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  33.07 
 
 		 629 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  33.07 
 
 		 629 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  31.24 
 
 		 626 aa  276  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  31.24 
 
 		 626 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  31.24 
 
 		 626 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  33.07 
 
 		 629 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  34.52 
 
 		 597 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.6 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  32.92 
 
 		 629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  33.67 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  32.92 
 
 		 629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  32.92 
 
 		 629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  33.67 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  33.67 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  32.92 
 
 		 629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  31.47 
 
 		 589 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  31.5 
 
 		 638 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  32.24 
 
 		 597 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  31.17 
 
 		 588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  32.27 
 
 		 660 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  31.01 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  30.73 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  32.07 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  30.73 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  31.82 
 
 		 646 aa  267  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  30.3 
 
 		 654 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  30.58 
 
 		 626 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.13 
 
 		 588 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  30.58 
 
 		 626 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  32.59 
 
 		 595 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.77 
 
 		 629 aa  265  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  32.35 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  31.77 
 
 		 595 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.82 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  31.52 
 
 		 633 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  31.57 
 
 		 616 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  31.52 
 
 		 633 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>