175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4086 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  100 
 
 		 638 aa  1270    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.74 
 
 		 630 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  47.43 
 
 		 619 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  47.36 
 
 		 619 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  46.7 
 
 		 620 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  44.9 
 
 		 619 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  45.09 
 
 		 623 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.09 
 
 		 623 aa  495  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  45.09 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  44.78 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  45.09 
 
 		 623 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  45.09 
 
 		 623 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  45.09 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  45.09 
 
 		 623 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  44.94 
 
 		 623 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  43.21 
 
 		 625 aa  492  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  43.01 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  40.9 
 
 		 628 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  43.87 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  43.87 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  43.87 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  43.87 
 
 		 629 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  43.87 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.5 
 
 		 629 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  41.09 
 
 		 626 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  43.87 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.69 
 
 		 624 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  43.71 
 
 		 629 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  40.54 
 
 		 624 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  41.54 
 
 		 624 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  41.72 
 
 		 629 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  40.41 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  40.41 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  39.94 
 
 		 626 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  40.09 
 
 		 626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  39.53 
 
 		 626 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  40.03 
 
 		 626 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  40.91 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  40.03 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  40.91 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  40.91 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  38.12 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  38.12 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  39.56 
 
 		 629 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  39.31 
 
 		 630 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  38.12 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  38.04 
 
 		 629 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  38.41 
 
 		 629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  37.97 
 
 		 654 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  37.27 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.13 
 
 		 628 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35 
 
 		 652 aa  346  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  35.13 
 
 		 633 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  34.27 
 
 		 637 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.13 
 
 		 642 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.09 
 
 		 647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  32.1 
 
 		 610 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  31.66 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  31.51 
 
 		 606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  32.11 
 
 		 606 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  31.2 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  30.47 
 
 		 611 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  28.79 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  33.7 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  31.49 
 
 		 641 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  33.39 
 
 		 597 aa  256  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.58 
 
 		 590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  33.59 
 
 		 597 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  33.91 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  32.44 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.4 
 
 		 590 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  31.65 
 
 		 616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.13 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.03 
 
 		 587 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  33.18 
 
 		 620 aa  230  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  30.41 
 
 		 589 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  30.65 
 
 		 612 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  30.65 
 
 		 612 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  30.5 
 
 		 612 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  30.5 
 
 		 612 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  31 
 
 		 611 aa  220  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  30.5 
 
 		 612 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  30.19 
 
 		 612 aa  217  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  28.91 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.78 
 
 		 592 aa  213  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.06 
 
 		 612 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  32.14 
 
 		 621 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  29.54 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  26.41 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  29.54 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  27.54 
 
 		 590 aa  208  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  26.55 
 
 		 582 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  29.41 
 
 		 611 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  28.26 
 
 		 610 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  29.39 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  29.39 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  29.39 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  31.83 
 
 		 621 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  28.35 
 
 		 588 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.06 
 
 		 588 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>