175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1280 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  51.27 
 
 
626 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  65.66 
 
 
629 aa  831    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  56.98 
 
 
628 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  56.69 
 
 
627 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  54.55 
 
 
626 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  65.66 
 
 
629 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  54.39 
 
 
626 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  56.85 
 
 
627 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  56.53 
 
 
627 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  53.58 
 
 
637 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  64.91 
 
 
629 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  60.86 
 
 
639 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  53.45 
 
 
642 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  54.23 
 
 
626 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  51.27 
 
 
626 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  66.03 
 
 
630 aa  851    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1276    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  67.36 
 
 
629 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  58.6 
 
 
626 aa  749    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  65.66 
 
 
629 aa  831    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  67.57 
 
 
629 aa  858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  65.66 
 
 
629 aa  831    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  51.27 
 
 
626 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  54.55 
 
 
626 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  65.82 
 
 
629 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  63.59 
 
 
629 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  53.24 
 
 
633 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  54.55 
 
 
626 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  65.82 
 
 
629 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  64.97 
 
 
629 aa  829    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  60.57 
 
 
654 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  55.18 
 
 
626 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  65.66 
 
 
629 aa  831    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  43.45 
 
 
623 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  43.13 
 
 
623 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  45.14 
 
 
641 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  42.97 
 
 
623 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  42.97 
 
 
623 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  42.97 
 
 
623 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  42.97 
 
 
623 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  42.97 
 
 
623 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  42.97 
 
 
623 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  42.81 
 
 
623 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  41.14 
 
 
623 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  43.08 
 
 
620 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  41.57 
 
 
628 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.75 
 
 
624 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  40.63 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  39.39 
 
 
624 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  40.95 
 
 
619 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  40.48 
 
 
619 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  40.63 
 
 
619 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  38.29 
 
 
638 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.87 
 
 
630 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  36.39 
 
 
625 aa  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.09 
 
 
652 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.52 
 
 
647 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  31.02 
 
 
611 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  30.63 
 
 
606 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  31.7 
 
 
605 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  30.3 
 
 
610 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.76 
 
 
590 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.28 
 
 
606 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  30 
 
 
606 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.98 
 
 
590 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  30 
 
 
606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  33.8 
 
 
621 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.16 
 
 
621 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  31.83 
 
 
620 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  30.43 
 
 
597 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  29.41 
 
 
611 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  29.41 
 
 
611 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.51 
 
 
612 aa  230  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  29.25 
 
 
611 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  30.89 
 
 
597 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  29.25 
 
 
611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  29.49 
 
 
589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  30.83 
 
 
597 aa  227  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  29.07 
 
 
611 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  29.07 
 
 
611 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  29.07 
 
 
611 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.08 
 
 
592 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  26.84 
 
 
609 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.57 
 
 
588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  30.3 
 
 
593 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  29.4 
 
 
614 aa  220  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  30.02 
 
 
589 aa  220  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  28.69 
 
 
612 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  29.4 
 
 
614 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  28.69 
 
 
612 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  29.4 
 
 
614 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  28.69 
 
 
612 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  28.53 
 
 
612 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  28.53 
 
 
612 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  29.91 
 
 
616 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  28.53 
 
 
612 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  27.07 
 
 
588 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  27.59 
 
 
611 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  25.23 
 
 
607 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  27.91 
 
 
589 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>