176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0449 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  84.8 
 
 
612 aa  1081    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  63.9 
 
 
616 aa  796    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  58.4 
 
 
611 aa  736    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  56.21 
 
 
610 aa  710    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  78.43 
 
 
612 aa  1002    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  96.07 
 
 
611 aa  1207    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  98.53 
 
 
611 aa  1234    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  79.25 
 
 
612 aa  1001    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1247    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  99.02 
 
 
611 aa  1235    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1247    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  98.69 
 
 
611 aa  1232    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  78.27 
 
 
612 aa  1001    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  78.27 
 
 
612 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  78.27 
 
 
612 aa  998    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  78.43 
 
 
612 aa  1002    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  100 
 
 
611 aa  1247    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  46.53 
 
 
660 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  46.88 
 
 
646 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  45.41 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  45.41 
 
 
633 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  45.41 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  45.41 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  45.57 
 
 
616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  45.57 
 
 
633 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  47.12 
 
 
605 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  47.12 
 
 
605 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  47.12 
 
 
605 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  44.79 
 
 
603 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  43.23 
 
 
620 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  41.9 
 
 
626 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  42.11 
 
 
611 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  42.51 
 
 
603 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  40.03 
 
 
606 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  39.71 
 
 
610 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  39.87 
 
 
606 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  39.71 
 
 
606 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  39.71 
 
 
606 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.34 
 
 
590 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.61 
 
 
590 aa  346  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.25 
 
 
605 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  35.69 
 
 
589 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  35.74 
 
 
589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  36.59 
 
 
597 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  37.07 
 
 
597 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.97 
 
 
623 aa  303  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  34.2 
 
 
586 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  33.17 
 
 
609 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  37.09 
 
 
597 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.03 
 
 
619 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  34.03 
 
 
619 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  34.13 
 
 
619 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  32.39 
 
 
628 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  32.91 
 
 
625 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  33.66 
 
 
623 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  33.33 
 
 
623 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.65 
 
 
624 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  33.75 
 
 
629 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.28 
 
 
592 aa  273  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.3 
 
 
593 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  33 
 
 
582 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.06 
 
 
630 aa  270  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.31 
 
 
623 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  32.39 
 
 
629 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.65 
 
 
629 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  32.46 
 
 
590 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  31.36 
 
 
607 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  32.17 
 
 
630 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  32.28 
 
 
582 aa  262  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.54 
 
 
626 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.01 
 
 
629 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  31.53 
 
 
588 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.74 
 
 
588 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  31.24 
 
 
629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  32.44 
 
 
596 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  33.17 
 
 
595 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.23 
 
 
588 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33.67 
 
 
587 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.69 
 
 
588 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.44 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.44 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.35 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  31.35 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.35 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  31.35 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.44 
 
 
629 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  29.09 
 
 
624 aa  244  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  29.34 
 
 
627 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  31.88 
 
 
608 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  29.34 
 
 
627 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  30.99 
 
 
620 aa  240  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  29.34 
 
 
627 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  34.6 
 
 
595 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  28.78 
 
 
626 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>