176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0431 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1147    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  64.12 
 
 		 576 aa  713    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  46.37 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  46.37 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  46.37 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  46.37 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  46.37 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  46.19 
 
 		 580 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  46.19 
 
 		 580 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  46.11 
 
 		 580 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  38.41 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  38.5 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  38.51 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  38.2 
 
 		 588 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  39.93 
 
 		 587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  36.56 
 
 		 582 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  36.9 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  36.75 
 
 		 595 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  37.04 
 
 		 595 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  37.65 
 
 		 596 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.61 
 
 		 588 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  37.09 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  34.19 
 
 		 583 aa  343  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  36.47 
 
 		 588 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  36.58 
 
 		 588 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.61 
 
 		 588 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.76 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  33.22 
 
 		 606 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  33.22 
 
 		 606 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  37.04 
 
 		 595 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  36.13 
 
 		 588 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  33.82 
 
 		 606 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  33.82 
 
 		 606 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  33.66 
 
 		 606 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  33.88 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  34.86 
 
 		 611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.4 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  35.68 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  35.62 
 
 		 604 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  32.41 
 
 		 616 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  32.41 
 
 		 616 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  32.41 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  35.56 
 
 		 606 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.23 
 
 		 590 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  31.06 
 
 		 617 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  31.38 
 
 		 617 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  35.33 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  34.53 
 
 		 517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  31.2 
 
 		 585 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  32.16 
 
 		 584 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  33.11 
 
 		 589 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  33.39 
 
 		 605 aa  233  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.39 
 
 		 592 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.51 
 
 		 612 aa  231  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  30.52 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  30.52 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  30.52 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  30.52 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  30.52 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  30.52 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.37 
 
 		 611 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  31.01 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  31.01 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  31.18 
 
 		 587 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  31.81 
 
 		 619 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  31 
 
 		 612 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  31 
 
 		 612 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  31 
 
 		 612 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  31 
 
 		 612 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.32 
 
 		 612 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  30.51 
 
 		 612 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  32.32 
 
 		 619 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  30.83 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  31.89 
 
 		 589 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  30.98 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  30.51 
 
 		 616 aa  217  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  30.46 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  31.35 
 
 		 619 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.5 
 
 		 593 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  28.59 
 
 		 609 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  31.51 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0021  hypothetical protein  27.52 
 
 		 589 aa  204  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.864029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  30.83 
 
 		 638 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.52 
 
 		 630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  31.54 
 
 		 623 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  31.54 
 
 		 623 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  31.54 
 
 		 623 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  31.54 
 
 		 623 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  31.43 
 
 		 623 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  30.37 
 
 		 625 aa  193  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  31.54 
 
 		 623 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  31.54 
 
 		 623 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  31.38 
 
 		 623 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.82 
 
 		 623 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.48 
 
 		 624 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  30.65 
 
 		 624 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  29.76 
 
 		 620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  30.34 
 
 		 623 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  26.01 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>