176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3612 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  65.21 
 
 
595 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  80.85 
 
 
517 aa  884    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  82.69 
 
 
595 aa  1033    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  92.78 
 
 
526 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1204    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  77.18 
 
 
596 aa  952    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  40.44 
 
 
583 aa  475  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  42.36 
 
 
590 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  39.1 
 
 
582 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  41.45 
 
 
587 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  38.6 
 
 
582 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  40.72 
 
 
589 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  39.21 
 
 
588 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  38.79 
 
 
588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  37.94 
 
 
606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  37.94 
 
 
606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.83 
 
 
588 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.27 
 
 
588 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.11 
 
 
588 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  38.22 
 
 
588 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  36.14 
 
 
588 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  36.8 
 
 
588 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  36.3 
 
 
588 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  34.71 
 
 
617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  35.18 
 
 
617 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  34.92 
 
 
616 aa  343  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  34.92 
 
 
616 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  34.92 
 
 
616 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  38.41 
 
 
576 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  36.5 
 
 
580 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  36.5 
 
 
580 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  36.5 
 
 
580 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  36.5 
 
 
580 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  36.5 
 
 
580 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  36.33 
 
 
580 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  36.33 
 
 
580 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  37.06 
 
 
580 aa  326  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  36.77 
 
 
577 aa  323  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  34.46 
 
 
611 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  34.32 
 
 
606 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  32.25 
 
 
604 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  34.27 
 
 
587 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  34.27 
 
 
587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  34.43 
 
 
587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  34.1 
 
 
587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  34.35 
 
 
608 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  34.6 
 
 
589 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  33.49 
 
 
606 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  33.23 
 
 
606 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  33.23 
 
 
606 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.8 
 
 
610 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  31.8 
 
 
584 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  33.02 
 
 
606 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  34.6 
 
 
611 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  34.6 
 
 
611 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  34.6 
 
 
611 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  34.13 
 
 
611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  34.13 
 
 
611 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  34.13 
 
 
611 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.28 
 
 
612 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.65 
 
 
611 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.37 
 
 
590 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  32.75 
 
 
616 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  31.43 
 
 
610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.34 
 
 
590 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  30.91 
 
 
605 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  32.37 
 
 
612 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  33.12 
 
 
612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  33.12 
 
 
612 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  33.12 
 
 
612 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  29.55 
 
 
585 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  33.12 
 
 
612 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  33.12 
 
 
612 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  29.46 
 
 
589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  31.64 
 
 
611 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.73 
 
 
623 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  32.2 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  31.86 
 
 
597 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  30.78 
 
 
586 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  32.03 
 
 
597 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  32.14 
 
 
620 aa  208  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  29.28 
 
 
628 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  30.03 
 
 
592 aa  206  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.55 
 
 
624 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  32.26 
 
 
597 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  29.46 
 
 
624 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  29.28 
 
 
625 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.2 
 
 
609 aa  200  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.3 
 
 
630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  29.82 
 
 
623 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  29.82 
 
 
623 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  29.82 
 
 
623 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  29.82 
 
 
623 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  29.82 
 
 
623 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  29.36 
 
 
593 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  29.67 
 
 
623 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  29.67 
 
 
623 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  30 
 
 
629 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  27.66 
 
 
607 aa  193  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  29.56 
 
 
623 aa  193  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>