176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1199 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  52.37 
 
 
588 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  56.14 
 
 
587 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  56.83 
 
 
590 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1212    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  65.7 
 
 
588 aa  804    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  52.03 
 
 
588 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  52.29 
 
 
588 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  72.67 
 
 
589 aa  907    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  48.68 
 
 
606 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  48.68 
 
 
606 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  46.01 
 
 
588 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  46.35 
 
 
588 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  46.01 
 
 
588 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  45.67 
 
 
588 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  40.26 
 
 
617 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  39.84 
 
 
617 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  41.12 
 
 
616 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  41.12 
 
 
616 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  41.12 
 
 
616 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  40.88 
 
 
582 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  40.71 
 
 
582 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  38.6 
 
 
595 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  38.79 
 
 
596 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  37.89 
 
 
595 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  38.95 
 
 
595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  37.71 
 
 
577 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  36.84 
 
 
576 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  34.17 
 
 
583 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  36.9 
 
 
526 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  32.83 
 
 
580 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  32.83 
 
 
580 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  32.83 
 
 
580 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  32.83 
 
 
580 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  32.83 
 
 
580 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  32.66 
 
 
580 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  32.66 
 
 
580 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  35.07 
 
 
517 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  31.76 
 
 
580 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  31.9 
 
 
608 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  32.35 
 
 
606 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  30.45 
 
 
604 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.39 
 
 
590 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.22 
 
 
590 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.34 
 
 
610 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  30.76 
 
 
611 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  30.68 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  31.34 
 
 
606 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  30.86 
 
 
606 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  31.34 
 
 
606 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.86 
 
 
606 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  31.07 
 
 
587 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  30.9 
 
 
587 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  30.95 
 
 
587 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  29.97 
 
 
589 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  30.73 
 
 
587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  29.65 
 
 
623 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  29.02 
 
 
585 aa  246  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  29.68 
 
 
623 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  29.68 
 
 
623 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  29.68 
 
 
623 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  29.68 
 
 
623 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  29.68 
 
 
623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  28.59 
 
 
619 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  29.52 
 
 
623 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  29.52 
 
 
623 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  28.93 
 
 
619 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  28.91 
 
 
625 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  29.37 
 
 
623 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  30.64 
 
 
610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.81 
 
 
611 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.49 
 
 
612 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  30.48 
 
 
611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  30.31 
 
 
611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  30.48 
 
 
611 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  30.48 
 
 
611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  30.48 
 
 
611 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  30.48 
 
 
611 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  29.35 
 
 
605 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  31.16 
 
 
616 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  31.14 
 
 
611 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  27.87 
 
 
628 aa  232  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  30.37 
 
 
597 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  30.38 
 
 
612 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  29.49 
 
 
612 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  29.49 
 
 
612 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  28.93 
 
 
619 aa  230  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  29.49 
 
 
612 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  29.49 
 
 
612 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  29.49 
 
 
612 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.64 
 
 
623 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  28.6 
 
 
597 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  28.6 
 
 
597 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  28.46 
 
 
609 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  29.15 
 
 
620 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  29.8 
 
 
589 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  27.37 
 
 
624 aa  219  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  28.6 
 
 
589 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  27.74 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  28.28 
 
 
624 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.87 
 
 
630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>