175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2818 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1219    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  35.91 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  35.91 
 
 		 608 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  33.56 
 
 		 604 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  33.79 
 
 		 589 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  33.22 
 
 		 587 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  33.56 
 
 		 587 aa  329  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  33.39 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  33.39 
 
 		 587 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  32.94 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  31.73 
 
 		 587 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  30.41 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.85 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.84 
 
 		 588 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.44 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.78 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.28 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  27.01 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  29.51 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  27.01 
 
 		 582 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  31.2 
 
 		 577 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  28.52 
 
 		 583 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  28.89 
 
 		 606 aa  246  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  28.89 
 
 		 606 aa  246  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.9 
 
 		 588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  30.22 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  28.66 
 
 		 596 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  28.03 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  29.94 
 
 		 611 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  28.24 
 
 		 580 aa  234  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  28.53 
 
 		 595 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  28.22 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  27.57 
 
 		 606 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  26.76 
 
 		 595 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  27.57 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  27.73 
 
 		 606 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  28.73 
 
 		 595 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  27.15 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  26.57 
 
 		 610 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  27.41 
 
 		 606 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  28.02 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  25.2 
 
 		 617 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  25.4 
 
 		 617 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  25.79 
 
 		 590 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  27.91 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  27.91 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  27.91 
 
 		 611 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  24.8 
 
 		 616 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  24.8 
 
 		 616 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  24.8 
 
 		 616 aa  203  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  27.75 
 
 		 611 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  27.75 
 
 		 611 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  27.75 
 
 		 611 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  24.92 
 
 		 590 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  28.07 
 
 		 611 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.37 
 
 		 623 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.39 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  26.58 
 
 		 610 aa  197  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  28.41 
 
 		 605 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  28.8 
 
 		 612 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  28.8 
 
 		 612 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  28.09 
 
 		 612 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  28.09 
 
 		 612 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  28.09 
 
 		 612 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  26.27 
 
 		 589 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  28.69 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  27.33 
 
 		 612 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  28.52 
 
 		 597 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  29.25 
 
 		 589 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  27.34 
 
 		 625 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  28.71 
 
 		 629 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.29 
 
 		 630 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  28.76 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  25.59 
 
 		 609 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  27.92 
 
 		 597 aa  183  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  26.68 
 
 		 586 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  27.36 
 
 		 623 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  26.95 
 
 		 624 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  26.25 
 
 		 517 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  26.53 
 
 		 626 aa  180  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  26.53 
 
 		 626 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  26.53 
 
 		 626 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.48 
 
 		 624 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  28.23 
 
 		 629 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  25.7 
 
 		 611 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  27.29 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  24.8 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.9 
 
 		 629 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  27.02 
 
 		 623 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  27.02 
 
 		 623 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>