175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01961 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1250    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  63.9 
 
 		 611 aa  796    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  56.08 
 
 		 610 aa  694    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  60.98 
 
 		 612 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  63.74 
 
 		 611 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  63.58 
 
 		 611 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  63.25 
 
 		 611 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  60.98 
 
 		 612 aa  760    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  63.9 
 
 		 611 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  63.58 
 
 		 611 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  63.9 
 
 		 611 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  63.74 
 
 		 612 aa  806    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  60.81 
 
 		 612 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  60.81 
 
 		 612 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  60.81 
 
 		 612 aa  765    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  60.98 
 
 		 612 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  58.86 
 
 		 611 aa  752    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  48.24 
 
 		 660 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  47.76 
 
 		 616 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  47.6 
 
 		 616 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  47.6 
 
 		 616 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  47.6 
 
 		 616 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  47.35 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  47.19 
 
 		 633 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  44.87 
 
 		 620 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  43.53 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  44.59 
 
 		 605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  44.59 
 
 		 605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  44.59 
 
 		 605 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  42.53 
 
 		 646 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  40.68 
 
 		 603 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  39.94 
 
 		 626 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  38.42 
 
 		 610 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  38.62 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  38.82 
 
 		 606 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  39.1 
 
 		 606 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  40.13 
 
 		 603 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  39.45 
 
 		 606 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.62 
 
 		 590 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  37.14 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.5 
 
 		 590 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  38.1 
 
 		 597 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  35.56 
 
 		 589 aa  317  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  37.94 
 
 		 597 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  37.74 
 
 		 597 aa  316  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  33.55 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.54 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  32.24 
 
 		 628 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  33.93 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  33.93 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  33.93 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.92 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  33.93 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  33.93 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  33.93 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  33.33 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  33.6 
 
 		 623 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  32.96 
 
 		 623 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  33.49 
 
 		 619 aa  280  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.39 
 
 		 619 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  33.49 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  33.93 
 
 		 625 aa  277  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  33.07 
 
 		 623 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.78 
 
 		 624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  35.08 
 
 		 587 aa  270  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  32.29 
 
 		 624 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  31.04 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.28 
 
 		 630 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.46 
 
 		 593 aa  263  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.39 
 
 		 629 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  30.84 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.71 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  31.59 
 
 		 620 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  29.76 
 
 		 626 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  29.76 
 
 		 626 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  29.76 
 
 		 626 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  30.88 
 
 		 627 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  32.13 
 
 		 588 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  30.72 
 
 		 627 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.92 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.14 
 
 		 629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  31.47 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  31.86 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  31.15 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  30.69 
 
 		 630 aa  244  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  31.6 
 
 		 629 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  30.71 
 
 		 590 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  30.56 
 
 		 627 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.61 
 
 		 629 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  29.81 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  29.82 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.88 
 
 		 629 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.88 
 
 		 629 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6519  hypothetical protein  40.05 
 
 		 410 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  29.72 
 
 		 626 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  29.72 
 
 		 626 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  29.84 
 
 		 611 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.88 
 
 		 629 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.94 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.94 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>