175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000025 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  100 
 
 
607 aa  1264    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  39.41 
 
 
609 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  35.64 
 
 
611 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  32.9 
 
 
605 aa  360  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  32.48 
 
 
606 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  32.64 
 
 
606 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  32.27 
 
 
606 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  32.38 
 
 
606 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  32.43 
 
 
610 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  32.59 
 
 
611 aa  316  8e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  31 
 
 
592 aa  296  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  27.61 
 
 
593 aa  287  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.15 
 
 
590 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  30.46 
 
 
623 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  30.2 
 
 
623 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  30.2 
 
 
623 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  30.2 
 
 
623 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  30.2 
 
 
623 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.87 
 
 
590 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  29.73 
 
 
623 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  30.2 
 
 
623 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  29.58 
 
 
623 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  30.23 
 
 
623 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  29.7 
 
 
619 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  29.7 
 
 
619 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  31.04 
 
 
616 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  28.71 
 
 
589 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  31.36 
 
 
611 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  31.36 
 
 
611 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  31.36 
 
 
611 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.15 
 
 
612 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  31.2 
 
 
611 aa  261  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  30.93 
 
 
611 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  30.93 
 
 
611 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.88 
 
 
611 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  28.35 
 
 
625 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  29.75 
 
 
620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  28.43 
 
 
619 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  28.43 
 
 
611 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.81 
 
 
630 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  29.15 
 
 
612 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  29.15 
 
 
612 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  29.15 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  29.15 
 
 
612 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  29.15 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  31.13 
 
 
628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  30.92 
 
 
589 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.66 
 
 
623 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  29.11 
 
 
586 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  28.03 
 
 
630 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  28.99 
 
 
612 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  29.17 
 
 
624 aa  237  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  28.13 
 
 
629 aa  237  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  30.2 
 
 
597 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  29.65 
 
 
597 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  27.56 
 
 
624 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  28.16 
 
 
610 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  30.72 
 
 
590 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.56 
 
 
588 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  27.8 
 
 
626 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  27.8 
 
 
626 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  27.8 
 
 
626 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  27.82 
 
 
638 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  29.59 
 
 
582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.4 
 
 
588 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.68 
 
 
624 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  29.59 
 
 
582 aa  226  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  28.19 
 
 
626 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  28.19 
 
 
626 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  28.19 
 
 
626 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.01 
 
 
629 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  27.05 
 
 
629 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  28.19 
 
 
626 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.36 
 
 
626 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  28.76 
 
 
597 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.96 
 
 
588 aa  220  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  26.65 
 
 
629 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.55 
 
 
652 aa  216  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  27.82 
 
 
626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  26.88 
 
 
629 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  26.84 
 
 
629 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  26.84 
 
 
629 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  26.84 
 
 
629 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  26.56 
 
 
626 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  26.73 
 
 
639 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  26.84 
 
 
629 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  26.84 
 
 
629 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  26.84 
 
 
629 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  26.84 
 
 
629 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  25.23 
 
 
629 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  25.69 
 
 
593 aa  204  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.58 
 
 
647 aa  203  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  28.14 
 
 
596 aa  203  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  28.86 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  28.46 
 
 
588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  27.69 
 
 
595 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  27.5 
 
 
646 aa  198  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  25.98 
 
 
654 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  27.45 
 
 
588 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  27.23 
 
 
606 aa  197  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>