175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2329 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  82.71 
 
 		 619 aa  1058    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  52.64 
 
 		 625 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  83.04 
 
 		 619 aa  1061    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1253    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  48.48 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  47.71 
 
 		 630 aa  558  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  49.28 
 
 		 620 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  47.69 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  47.69 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  47.69 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  47.53 
 
 		 623 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  47.69 
 
 		 623 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  47.69 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  47.53 
 
 		 623 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  47.69 
 
 		 623 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  47.05 
 
 		 623 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  47.2 
 
 		 624 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  45.77 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  45.47 
 
 		 628 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.68 
 
 		 624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  44.5 
 
 		 626 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  44.69 
 
 		 638 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  43.58 
 
 		 629 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.63 
 
 		 629 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  41.88 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  44.71 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  41.63 
 
 		 626 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  41.63 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  44.71 
 
 		 629 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  43.26 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  41.88 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  44.71 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  42.54 
 
 		 629 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  44.71 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  44.71 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  44.55 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  44.71 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  41.31 
 
 		 626 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  42.31 
 
 		 630 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  41.31 
 
 		 626 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  41.31 
 
 		 626 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  42.26 
 
 		 626 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  41.79 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  41.97 
 
 		 627 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  41.81 
 
 		 627 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  41.65 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  39.84 
 
 		 629 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  40.95 
 
 		 629 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.36 
 
 		 652 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  39.75 
 
 		 654 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.12 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  38.7 
 
 		 639 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.65 
 
 		 628 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  36.62 
 
 		 633 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  36.23 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.53 
 
 		 642 aa  360  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  35.62 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  36.39 
 
 		 611 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  35.55 
 
 		 606 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  35.39 
 
 		 606 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  35.39 
 
 		 606 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  34.91 
 
 		 606 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  38.34 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.12 
 
 		 590 aa  332  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.15 
 
 		 590 aa  327  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  32.65 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.87 
 
 		 612 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  33.77 
 
 		 589 aa  294  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  33.88 
 
 		 586 aa  294  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  34.43 
 
 		 621 aa  293  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  34.13 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  34.13 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  34.13 
 
 		 611 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  34.13 
 
 		 611 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  34.13 
 
 		 611 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  34.13 
 
 		 611 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.79 
 
 		 621 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.55 
 
 		 611 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.06 
 
 		 597 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.33 
 
 		 611 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  35.06 
 
 		 597 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  34.18 
 
 		 620 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  33.39 
 
 		 616 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  34.09 
 
 		 589 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  31.88 
 
 		 641 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  33.23 
 
 		 612 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  33.23 
 
 		 612 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  33.55 
 
 		 612 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  33.07 
 
 		 612 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  33.07 
 
 		 612 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  33.28 
 
 		 612 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  34.85 
 
 		 597 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33.49 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  31.34 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.41 
 
 		 592 aa  253  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.43 
 
 		 607 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  33.97 
 
 		 593 aa  250  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  31.16 
 
 		 588 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  31 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  31.32 
 
 		 588 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>