175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1289 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  70.4 
 
 		 603 aa  878    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  100 
 
 		 603 aa  1228    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  45.47 
 
 		 646 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  45.89 
 
 		 605 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  45.89 
 
 		 605 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  45.89 
 
 		 605 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  42.46 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  42.05 
 
 		 612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  42.46 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  42.46 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  42.46 
 
 		 612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  42.35 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  42.51 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  42.14 
 
 		 612 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  42.67 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  41.76 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  41.04 
 
 		 612 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  42.51 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  42.51 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  42.51 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  39.39 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  40.13 
 
 		 616 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  37.95 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  35.07 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  35.91 
 
 		 616 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  35.75 
 
 		 633 aa  323  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  35.75 
 
 		 616 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  35.75 
 
 		 616 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  35.75 
 
 		 616 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  35.59 
 
 		 633 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  35.27 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  34.96 
 
 		 620 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  31.77 
 
 		 611 aa  273  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  30.08 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  30.1 
 
 		 606 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  30.55 
 
 		 606 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.46 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  30.47 
 
 		 606 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  30.45 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  29.43 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.74 
 
 		 590 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  30.17 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6519  hypothetical protein  36.48 
 
 		 410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.13 
 
 		 590 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  29.18 
 
 		 624 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  29.77 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  29.6 
 
 		 597 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  29.76 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  30.02 
 
 		 597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  29.45 
 
 		 619 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  28.96 
 
 		 605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  25.24 
 
 		 609 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  28.84 
 
 		 619 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  30.55 
 
 		 623 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  30.39 
 
 		 623 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  30.39 
 
 		 623 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  30.39 
 
 		 623 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  30.39 
 
 		 623 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  30.39 
 
 		 623 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.62 
 
 		 630 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  29.48 
 
 		 623 aa  180  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  30.24 
 
 		 623 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.17 
 
 		 624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.85 
 
 		 623 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  29.71 
 
 		 587 aa  173  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  27.75 
 
 		 596 aa  173  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  29.53 
 
 		 623 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  27.77 
 
 		 626 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  28.1 
 
 		 630 aa  171  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  27.04 
 
 		 625 aa  170  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  27.94 
 
 		 624 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  27.65 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  27.86 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  25.64 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  26.05 
 
 		 628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  25.91 
 
 		 606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  26.21 
 
 		 595 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  25.48 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.88 
 
 		 629 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  27.86 
 
 		 626 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  27.86 
 
 		 626 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  27.86 
 
 		 626 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  27.81 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  26.79 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  27.82 
 
 		 620 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  27.08 
 
 		 629 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  27.2 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  26.53 
 
 		 626 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  27.92 
 
 		 629 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  26.67 
 
 		 604 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.82 
 
 		 626 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  25.9 
 
 		 626 aa  159  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  25.9 
 
 		 626 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  25.9 
 
 		 626 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  28.1 
 
 		 654 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  27.58 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  27.44 
 
 		 629 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  26.43 
 
 		 593 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  25.24 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  26.43 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>