175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0502 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1248    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  99.51 
 
 
633 aa  1246    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  58.28 
 
 
620 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  93.18 
 
 
660 aa  1147    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1248    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1248    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  99.51 
 
 
616 aa  1244    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  99.68 
 
 
633 aa  1247    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  49.92 
 
 
611 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  47.35 
 
 
616 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  45.66 
 
 
612 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  45.73 
 
 
611 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  45.57 
 
 
611 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  45.73 
 
 
611 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  45.89 
 
 
611 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  45.73 
 
 
611 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  45.57 
 
 
611 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  45.41 
 
 
611 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  45.82 
 
 
612 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  46.3 
 
 
612 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  45.66 
 
 
612 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  45.66 
 
 
612 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  45.82 
 
 
612 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  45.66 
 
 
612 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  43.2 
 
 
610 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  38.55 
 
 
605 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  38.55 
 
 
605 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  38.55 
 
 
605 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  37.74 
 
 
646 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  35.75 
 
 
603 aa  337  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  35.32 
 
 
626 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  34.83 
 
 
603 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  34.35 
 
 
611 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.85 
 
 
610 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  31.94 
 
 
606 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  32.05 
 
 
606 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  31.94 
 
 
606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  31.78 
 
 
606 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.64 
 
 
590 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  35.31 
 
 
597 aa  266  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  35.38 
 
 
597 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.22 
 
 
597 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.07 
 
 
590 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  31.56 
 
 
609 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  32.56 
 
 
589 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  31.8 
 
 
589 aa  241  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.81 
 
 
592 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  31.5 
 
 
628 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  31.51 
 
 
619 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  32.15 
 
 
619 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  30.26 
 
 
605 aa  217  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  30.02 
 
 
619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  30.33 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  30.4 
 
 
623 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  30.22 
 
 
625 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  29.5 
 
 
623 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  29.5 
 
 
623 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  29.84 
 
 
623 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  31.87 
 
 
587 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  29.84 
 
 
623 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  29.84 
 
 
623 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  29.84 
 
 
623 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  30.87 
 
 
589 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  29.57 
 
 
623 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  29.47 
 
 
623 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.04 
 
 
588 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.09 
 
 
623 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  29.43 
 
 
629 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  29.61 
 
 
588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.78 
 
 
624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.24 
 
 
629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.87 
 
 
588 aa  198  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  30.54 
 
 
627 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  30.58 
 
 
627 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.97 
 
 
588 aa  194  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  29.48 
 
 
630 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  30.39 
 
 
627 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  27.52 
 
 
588 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.22 
 
 
588 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  26.07 
 
 
611 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  26.54 
 
 
607 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  27.77 
 
 
624 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  29.08 
 
 
629 aa  190  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  27.6 
 
 
588 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  29.64 
 
 
588 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.26 
 
 
647 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.03 
 
 
588 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  28.08 
 
 
629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  29.02 
 
 
593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  28.62 
 
 
629 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  25.36 
 
 
593 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  29.29 
 
 
604 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  28.4 
 
 
626 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.24 
 
 
630 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.29 
 
 
626 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  28.24 
 
 
626 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  28.24 
 
 
626 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  28.24 
 
 
626 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  27.11 
 
 
626 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  27.11 
 
 
626 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>