175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0951 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1208    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  86.28 
 
 
646 aa  1008    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  99.83 
 
 
605 aa  1206    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  99.83 
 
 
605 aa  1207    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  48.03 
 
 
612 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  47.87 
 
 
612 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  47.87 
 
 
612 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  48.03 
 
 
612 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  47.12 
 
 
611 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  47.12 
 
 
611 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  47.12 
 
 
611 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  47.87 
 
 
612 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  47.12 
 
 
611 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  47.12 
 
 
611 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  47.12 
 
 
611 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  45.39 
 
 
612 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  46.56 
 
 
611 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  47.21 
 
 
612 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  45.89 
 
 
603 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  45.92 
 
 
603 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  44.92 
 
 
626 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  44.59 
 
 
616 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  39.38 
 
 
610 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  41.12 
 
 
611 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  39.74 
 
 
660 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  38.55 
 
 
616 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  38.55 
 
 
633 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  38.39 
 
 
616 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  38.39 
 
 
616 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  38.39 
 
 
616 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  38.39 
 
 
633 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  38.09 
 
 
620 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  33.66 
 
 
611 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  34.22 
 
 
606 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.22 
 
 
606 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  34.39 
 
 
606 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  34.11 
 
 
606 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.68 
 
 
610 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6519  hypothetical protein  44.35 
 
 
410 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  28.81 
 
 
589 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.41 
 
 
590 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  30.79 
 
 
589 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.05 
 
 
590 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  28.91 
 
 
586 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.18 
 
 
609 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  32.3 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  30.26 
 
 
619 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  32.14 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  29.85 
 
 
619 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  32.85 
 
 
605 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  30.07 
 
 
619 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  32.77 
 
 
597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  29.84 
 
 
590 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.42 
 
 
630 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.24 
 
 
592 aa  187  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  30.6 
 
 
587 aa  187  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  26.48 
 
 
607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  29.11 
 
 
629 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.62 
 
 
629 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  27.56 
 
 
630 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  26.14 
 
 
593 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  29.1 
 
 
593 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.65 
 
 
624 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  29.02 
 
 
596 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  30.9 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  29.02 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  30.9 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  30.9 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  30.9 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  27.27 
 
 
625 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  28.25 
 
 
595 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  28.43 
 
 
588 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  30.74 
 
 
623 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.14 
 
 
588 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  30.28 
 
 
629 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  30.74 
 
 
623 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  30.59 
 
 
623 aa  171  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  30.48 
 
 
623 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.6 
 
 
588 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  26.58 
 
 
582 aa  170  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.31 
 
 
623 aa  170  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.71 
 
 
588 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  28.87 
 
 
629 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  28.5 
 
 
629 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  28.87 
 
 
629 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.21 
 
 
588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  28.53 
 
 
629 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  28.53 
 
 
629 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  28.53 
 
 
629 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  28.53 
 
 
629 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.48 
 
 
588 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  29.57 
 
 
595 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.38 
 
 
588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  27.75 
 
 
629 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  27.21 
 
 
587 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  29.55 
 
 
629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  29.11 
 
 
608 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  27.06 
 
 
587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  28.44 
 
 
654 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  26.15 
 
 
628 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>