232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004412 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  100 
 
 		 494 aa  998    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  70.04 
 
 		 478 aa  704    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  72.27 
 
 		 487 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  81.76 
 
 		 499 aa  815    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  94.13 
 
 		 494 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  71.4 
 
 		 479 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  72.54 
 
 		 482 aa  727    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  72.54 
 
 		 482 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  70.93 
 
 		 486 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  71.78 
 
 		 484 aa  722    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  72.73 
 
 		 477 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  73.05 
 
 		 486 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  72.31 
 
 		 478 aa  725    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  72.27 
 
 		 487 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  72.13 
 
 		 482 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  87.65 
 
 		 494 aa  889    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  71.49 
 
 		 478 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  74.69 
 
 		 392 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  56.4 
 
 		 527 aa  545  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  52.86 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  55.6 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  56.1 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  55.25 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  53.37 
 
 		 489 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  55.9 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  53.76 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  50.94 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  50.73 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  48.98 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  48.98 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  51.56 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  48.98 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  50.94 
 
 		 484 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  48.98 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  48.78 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  50.11 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  48.32 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.3 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  46.3 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  46.3 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  47.01 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  47.01 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  47.01 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  46.37 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  45.88 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  47.01 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  45.44 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  44.81 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  51.25 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  44 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  43.56 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  28.91 
 
 		 537 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  29.45 
 
 		 555 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  30.53 
 
 		 546 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.86 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  27.16 
 
 		 599 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.19 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  28.32 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.34 
 
 		 559 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  25.4 
 
 		 573 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  27.9 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  29.49 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27.79 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  25.98 
 
 		 537 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  27.66 
 
 		 615 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  27.78 
 
 		 539 aa  123  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  26.73 
 
 		 606 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  25.27 
 
 		 696 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  28.06 
 
 		 590 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  25.99 
 
 		 603 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  27.85 
 
 		 647 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  25.36 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  39.88 
 
 		 599 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  27.34 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  26.62 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  25.37 
 
 		 690 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  24.65 
 
 		 707 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  28.29 
 
 		 688 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  27.98 
 
 		 615 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  23.68 
 
 		 696 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  24.95 
 
 		 684 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  24.77 
 
 		 692 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  29.61 
 
 		 690 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  24.95 
 
 		 692 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 688 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  24.77 
 
 		 692 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 688 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  24.77 
 
 		 692 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  25.45 
 
 		 615 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  24.77 
 
 		 688 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  25.98 
 
 		 614 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  27.98 
 
 		 684 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  30.45 
 
 		 692 aa  106  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  25.14 
 
 		 691 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  24.41 
 
 		 692 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.3 
 
 		 753 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  28.77 
 
 		 691 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  24.64 
 
 		 692 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  24.41 
 
 		 692 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  25.75 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>