232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3960 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 613 aa  1233    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  59.8 
 
 		 615 aa  727    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  53.52 
 
 		 606 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  58.52 
 
 		 647 aa  735    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  60.1 
 
 		 615 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  64.14 
 
 		 603 aa  782    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  69.98 
 
 		 613 aa  837    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  60.69 
 
 		 615 aa  739    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  53.2 
 
 		 589 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  55.66 
 
 		 642 aa  589  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  54.56 
 
 		 642 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  48.46 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 603 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 603 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  49.04 
 
 		 691 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  50.09 
 
 		 681 aa  535  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 603 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  48.52 
 
 		 691 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  47.93 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  47.93 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  47.41 
 
 		 692 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  47.76 
 
 		 692 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  47.76 
 
 		 692 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  47.76 
 
 		 692 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  47.41 
 
 		 692 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  47.59 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  47.82 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  47.04 
 
 		 685 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  47.46 
 
 		 686 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  48.52 
 
 		 696 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  48.51 
 
 		 692 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  47.29 
 
 		 687 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  48.85 
 
 		 695 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  48.85 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  46.69 
 
 		 685 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2095  carbon starvation protein CstA  46.23 
 
 		 604 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  47.41 
 
 		 692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  47.81 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  47.12 
 
 		 684 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  46.69 
 
 		 685 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  47.41 
 
 		 692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  47.41 
 
 		 692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  46.85 
 
 		 687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  46.95 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  48.34 
 
 		 696 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  48.15 
 
 		 689 aa  512  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  46.25 
 
 		 687 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  46.39 
 
 		 690 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 690 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  46.68 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  46.76 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  46.95 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  46.05 
 
 		 691 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  47.29 
 
 		 684 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  46.48 
 
 		 688 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  45.75 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  45.15 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  45.58 
 
 		 701 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1085  carbon starvation protein CstA  47.17 
 
 		 605 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  45.23 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  45.75 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  45.25 
 
 		 687 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  45.75 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  45.75 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  45.5 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  45.75 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  45.41 
 
 		 701 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  46.13 
 
 		 738 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  46.6 
 
 		 681 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  44.41 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  45.41 
 
 		 701 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  44.41 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  44.23 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  44.83 
 
 		 690 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  45.41 
 
 		 701 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  45.41 
 
 		 701 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  45.39 
 
 		 701 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  45.79 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  45.96 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  45.96 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  44.86 
 
 		 685 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  45.36 
 
 		 692 aa  495  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  47.29 
 
 		 688 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  45.79 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  45.61 
 
 		 688 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  45.22 
 
 		 688 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  46.38 
 
 		 684 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  46.22 
 
 		 716 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04186  hypothetical protein  46.22 
 
 		 716 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  46.22 
 
 		 704 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  46.74 
 
 		 716 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02026  carbon starvation protein A  47.93 
 
 		 690 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  46.74 
 
 		 716 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  46.74 
 
 		 716 aa  492  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  46.22 
 
 		 721 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  46.22 
 
 		 716 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  46.22 
 
 		 721 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  46.22 
 
 		 721 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  46.74 
 
 		 716 aa  492  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  46.74 
 
 		 716 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>