232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0951 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  100 
 
 
490 aa  980    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  47.72 
 
 
479 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  46.17 
 
 
478 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  44.95 
 
 
478 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  45.13 
 
 
478 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  44.67 
 
 
484 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  47.1 
 
 
479 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  44.47 
 
 
482 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  44.67 
 
 
482 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  46.53 
 
 
486 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  47.36 
 
 
477 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  44.88 
 
 
482 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  46.38 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  45.49 
 
 
487 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  45.49 
 
 
486 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  48.53 
 
 
473 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  45.49 
 
 
487 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  45.39 
 
 
472 aa  409  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  49.43 
 
 
472 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  47.06 
 
 
483 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  47.28 
 
 
483 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  47.85 
 
 
470 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  47.35 
 
 
486 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  44.8 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  48.19 
 
 
467 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  48.12 
 
 
489 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  44.09 
 
 
494 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  44.09 
 
 
494 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  44 
 
 
494 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  47.42 
 
 
472 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  41.06 
 
 
527 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  44.74 
 
 
484 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  47.77 
 
 
392 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  40.95 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  42.89 
 
 
480 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  42.89 
 
 
480 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  42.89 
 
 
480 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  42.89 
 
 
480 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  42.89 
 
 
480 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  36.81 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  38.1 
 
 
490 aa  319  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  37.93 
 
 
487 aa  319  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
490 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
490 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
490 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
490 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
491 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
491 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 
491 aa  316  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  36.91 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  34.96 
 
 
484 aa  279  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  27.42 
 
 
555 aa  140  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  27.25 
 
 
554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  26.88 
 
 
585 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  25.99 
 
 
564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  26.58 
 
 
537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  26.59 
 
 
586 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  25.49 
 
 
599 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  26.56 
 
 
555 aa  109  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  25.49 
 
 
590 aa  107  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  24.9 
 
 
573 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27.42 
 
 
561 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  24.3 
 
 
537 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  24.63 
 
 
691 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  24.65 
 
 
559 aa  104  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  26.77 
 
 
615 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  24.65 
 
 
559 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  26.65 
 
 
647 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  24.54 
 
 
539 aa  101  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  25.68 
 
 
753 aa  99  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  24.71 
 
 
691 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  27.29 
 
 
691 aa  98.2  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  29.39 
 
 
606 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  27.76 
 
 
603 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  28.12 
 
 
615 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  25.87 
 
 
614 aa  97.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  25.4 
 
 
611 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  26.33 
 
 
603 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  26.33 
 
 
603 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  27.33 
 
 
546 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  26.33 
 
 
603 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  25.09 
 
 
688 aa  94  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  25.17 
 
 
765 aa  93.6  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  23.89 
 
 
707 aa  93.2  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  25.57 
 
 
766 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  29.91 
 
 
589 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  24.17 
 
 
687 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  25.32 
 
 
686 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  26.63 
 
 
615 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  25.22 
 
 
684 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  25.04 
 
 
686 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  24.53 
 
 
692 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  24.53 
 
 
692 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  23.7 
 
 
692 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  23.7 
 
 
692 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  25.38 
 
 
695 aa  90.1  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  23.7 
 
 
692 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  24.53 
 
 
692 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  25.85 
 
 
681 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  23.73 
 
 
691 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>