232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0218 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  87.65 
 
 
494 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  71.54 
 
 
486 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  89.47 
 
 
494 aa  897    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  71.26 
 
 
487 aa  695    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  72.22 
 
 
479 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  79.3 
 
 
499 aa  787    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  71.52 
 
 
482 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  71.31 
 
 
482 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  71.31 
 
 
486 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  72.11 
 
 
478 aa  717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  71.57 
 
 
484 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  72.11 
 
 
477 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  70.25 
 
 
478 aa  705    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  73.14 
 
 
478 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  71.31 
 
 
482 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  100 
 
 
494 aa  999    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  71.26 
 
 
487 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  72.93 
 
 
392 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  54.14 
 
 
527 aa  547  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  55.85 
 
 
480 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  56.2 
 
 
473 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  50.82 
 
 
479 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  56.2 
 
 
470 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  53.56 
 
 
489 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  56.04 
 
 
486 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  55.25 
 
 
472 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  51.14 
 
 
483 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  50.31 
 
 
483 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  48.67 
 
 
480 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  48.67 
 
 
480 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  48.67 
 
 
480 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  50.89 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  50.4 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  48.67 
 
 
480 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  48.67 
 
 
480 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  50.11 
 
 
472 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  47.36 
 
 
490 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  46.14 
 
 
490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.64 
 
 
491 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  45.86 
 
 
491 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  45.93 
 
 
490 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  45.86 
 
 
491 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  46.14 
 
 
490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  46.14 
 
 
490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  45.74 
 
 
489 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  45.88 
 
 
487 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  45.44 
 
 
490 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  44.87 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  51.7 
 
 
472 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  44.09 
 
 
490 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  44.11 
 
 
484 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  28.34 
 
 
537 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  29.11 
 
 
555 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  30.2 
 
 
546 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.36 
 
 
559 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  27.42 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  26.57 
 
 
559 aa  140  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  26.72 
 
 
555 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.09 
 
 
573 aa  133  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  26.59 
 
 
585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  25.9 
 
 
599 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  28.33 
 
 
615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27.08 
 
 
561 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  28.49 
 
 
564 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  25.98 
 
 
537 aa  124  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  28.95 
 
 
539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  27.54 
 
 
606 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  27.79 
 
 
603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  29.46 
 
 
685 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  27.74 
 
 
615 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  36.79 
 
 
599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  25.53 
 
 
590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  25.41 
 
 
692 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  28 
 
 
688 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  28.44 
 
 
615 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  25.55 
 
 
696 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  25.42 
 
 
537 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  30 
 
 
691 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  26.06 
 
 
692 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  30.14 
 
 
692 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  25.41 
 
 
692 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  29.31 
 
 
685 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  29.33 
 
 
688 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  29.33 
 
 
688 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  25.18 
 
 
686 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  29.33 
 
 
688 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  29.03 
 
 
690 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  25.87 
 
 
692 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  25.41 
 
 
692 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  25.87 
 
 
692 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  25.37 
 
 
692 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  28.66 
 
 
685 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  28.66 
 
 
685 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  25.05 
 
 
687 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  25.05 
 
 
692 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  25.69 
 
 
692 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  29.24 
 
 
688 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  27.3 
 
 
765 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  27.67 
 
 
695 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  25.28 
 
 
692 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>