232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3574 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  65.11 
 
 		 716 aa  911    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  70.04 
 
 		 701 aa  971    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  65.11 
 
 		 716 aa  911    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  70.04 
 
 		 701 aa  972    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  72.43 
 
 		 688 aa  1002    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  65.11 
 
 		 721 aa  911    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  57.01 
 
 		 691 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  82.31 
 
 		 686 aa  1161    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  64.34 
 
 		 691 aa  819    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  58.01 
 
 		 703 aa  752    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  65.58 
 
 		 688 aa  916    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  70.04 
 
 		 701 aa  971    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  72.58 
 
 		 691 aa  992    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  70.04 
 
 		 701 aa  971    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  64.34 
 
 		 691 aa  818    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  79.42 
 
 		 692 aa  1115    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  64.34 
 
 		 691 aa  818    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  64.34 
 
 		 691 aa  818    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  72.73 
 
 		 691 aa  1010    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  70.04 
 
 		 701 aa  957    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  64.54 
 
 		 716 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  54.7 
 
 		 695 aa  684    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  95.8 
 
 		 690 aa  1315    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  80.2 
 
 		 692 aa  1102    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  72.99 
 
 		 688 aa  992    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  80 
 
 		 692 aa  1125    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  78.26 
 
 		 692 aa  1078    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  70 
 
 		 701 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5596  carbon starvation protein A  64.34 
 
 		 691 aa  818    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  72.14 
 
 		 688 aa  976    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  64.85 
 
 		 691 aa  842    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5666  carbon starvation protein A  64.34 
 
 		 691 aa  818    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.139081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  72.89 
 
 		 690 aa  1018    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  67.92 
 
 		 681 aa  897    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  70 
 
 		 701 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  64.68 
 
 		 716 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  79.57 
 
 		 692 aa  1097    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  56.33 
 
 		 756 aa  718    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  72.66 
 
 		 686 aa  1031    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  70.03 
 
 		 693 aa  922    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  69.15 
 
 		 696 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  55.83 
 
 		 689 aa  738    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  70 
 
 		 701 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  66.91 
 
 		 696 aa  927    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  64.68 
 
 		 716 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02026  carbon starvation protein A  70.36 
 
 		 690 aa  907    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 691 aa  1387    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  57.39 
 
 		 681 aa  751    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  79.42 
 
 		 692 aa  1116    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1798  carbon starvation protein CstA  52.86 
 
 		 764 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  55.27 
 
 		 707 aa  752    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  58.31 
 
 		 703 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  58.5 
 
 		 742 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  64.77 
 
 		 691 aa  881    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  71.37 
 
 		 685 aa  979    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  65.19 
 
 		 685 aa  898    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  65.44 
 
 		 688 aa  914    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  70 
 
 		 701 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0582  carbon starvation protein CstA  63.53 
 
 		 726 aa  903    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  83.19 
 
 		 684 aa  1139    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  64.54 
 
 		 716 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  71.99 
 
 		 688 aa  1001    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  80.14 
 
 		 692 aa  1129    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  71.99 
 
 		 688 aa  973    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D14  carbon starvation protein, membrane protein  47.81 
 
 		 784 aa  638    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  57.1 
 
 		 738 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  54.9 
 
 		 766 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  79.42 
 
 		 692 aa  1116    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  80 
 
 		 692 aa  1131    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  71.22 
 
 		 685 aa  992    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  79.42 
 
 		 692 aa  1118    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  55.51 
 
 		 692 aa  766    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  64.54 
 
 		 716 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  69.9 
 
 		 701 aa  972    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1845  carbon starvation protein CstA  52.86 
 
 		 764 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2024  carbon starvation protein CstA  51.08 
 
 		 767 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  65.11 
 
 		 721 aa  911    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13080  carbon starvation protein A cstA  53.32 
 
 		 758 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.585892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  78.86 
 
 		 687 aa  1094    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  58.01 
 
 		 703 aa  753    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  65.11 
 
 		 721 aa  911    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  80.76 
 
 		 688 aa  1104    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  65.25 
 
 		 721 aa  912    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  70.6 
 
 		 686 aa  952    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  80.2 
 
 		 692 aa  1102    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1779  carbon starvation protein CstA  52.86 
 
 		 764 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  80.2 
 
 		 692 aa  1102    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  65.85 
 
 		 704 aa  904    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  72.58 
 
 		 688 aa  1003    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4322  carbon starvation protein CstA  52.52 
 
 		 768 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  71.18 
 
 		 687 aa  961    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  64.43 
 
 		 717 aa  903    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  70.19 
 
 		 701 aa  969    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  65.11 
 
 		 716 aa  911    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  70.04 
 
 		 701 aa  971    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  65.58 
 
 		 688 aa  916    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  70 
 
 		 701 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  67.21 
 
 		 682 aa  929    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  70.16 
 
 		 684 aa  865    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  72.43 
 
 		 688 aa  1002    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>