231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0348 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  100 
 
 		 527 aa  1064    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  56.83 
 
 		 479 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  53.83 
 
 		 484 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  56.41 
 
 		 499 aa  551  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  54.14 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  53.42 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  53.23 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  54.13 
 
 		 486 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  53.51 
 
 		 478 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  53.23 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  54.23 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  54.14 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  56.8 
 
 		 494 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  56.4 
 
 		 494 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  56.02 
 
 		 477 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  53.55 
 
 		 487 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  53.55 
 
 		 487 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  53.55 
 
 		 486 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  52.67 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  52.67 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  50.68 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  55.88 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  51.37 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  50.29 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  48.08 
 
 		 470 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  48.56 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  47.75 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  47.64 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  47.56 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  47.17 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  45.19 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  45.19 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  45.19 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  43.4 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  45.58 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  45.58 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  45.16 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  42.8 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  43 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  43 
 
 		 490 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  43.39 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  43.39 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  43.61 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  43.39 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  43 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  42.8 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  42.41 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  42.07 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  46.17 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  40.86 
 
 		 490 aa  363  3e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  39.83 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  27.76 
 
 		 555 aa  146  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.17 
 
 		 559 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.36 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  30.23 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  26.78 
 
 		 555 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  26.93 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  26.45 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  26.38 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  29.85 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.16 
 
 		 573 aa  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  28.79 
 
 		 599 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  26.86 
 
 		 692 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  25.17 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  26.93 
 
 		 611 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  27.06 
 
 		 564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  30.05 
 
 		 753 aa  117  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  27.48 
 
 		 590 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  26.64 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  26.37 
 
 		 692 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0860  carbon starvation protein CstA  26.03 
 
 		 591 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.983517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  26.34 
 
 		 692 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  25.57 
 
 		 561 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  24.36 
 
 		 701 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  26.85 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  26.08 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  23.81 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  24.38 
 
 		 701 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  24.38 
 
 		 701 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  25.65 
 
 		 692 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  25.82 
 
 		 692 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  25.82 
 
 		 692 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  26.12 
 
 		 692 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  29.22 
 
 		 685 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  28.71 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  29.68 
 
 		 765 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  24.38 
 
 		 701 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  24.35 
 
 		 686 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  25.65 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  26.13 
 
 		 692 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  25.49 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  24.2 
 
 		 701 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  29.79 
 
 		 766 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>