232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2503 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  92.74 
 
 		 487 aa  883    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  96.17 
 
 		 392 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  70.08 
 
 		 499 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  92.74 
 
 		 487 aa  883    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  72.54 
 
 		 494 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  88.11 
 
 		 478 aa  845    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  72.65 
 
 		 494 aa  704    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  99.38 
 
 		 482 aa  956    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 482 aa  960    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  83.65 
 
 		 486 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  98.35 
 
 		 484 aa  947    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  85.89 
 
 		 477 aa  819    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  92.74 
 
 		 486 aa  884    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  87.97 
 
 		 478 aa  862    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  96.47 
 
 		 482 aa  932    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  71.31 
 
 		 494 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  85.95 
 
 		 479 aa  834    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  85.36 
 
 		 478 aa  834    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  53.23 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  55.32 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  56.67 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  57.86 
 
 		 486 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  55.65 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  53.89 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  53.59 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  54.32 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  52.79 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  52.79 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  50.41 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  50.41 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  50.41 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 480 aa  441  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  50.31 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  50.81 
 
 		 472 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  47.62 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  50.11 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  45.47 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  45.27 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  45.27 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  51.96 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  45.31 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  45.31 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  45.31 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  45.31 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  45.62 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  44.67 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  44.74 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  44.2 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  42.95 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  28.37 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.6 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  26.81 
 
 		 555 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  27.99 
 
 		 555 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.31 
 
 		 559 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.11 
 
 		 559 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  26.96 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  26.65 
 
 		 599 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  29.65 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  28.2 
 
 		 564 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  27.31 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  29.31 
 
 		 687 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  29.59 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.04 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  25.2 
 
 		 561 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.87 
 
 		 753 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  28.48 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  28.7 
 
 		 684 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  28.7 
 
 		 684 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  25.68 
 
 		 687 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  29.29 
 
 		 686 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  26.53 
 
 		 688 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  26.53 
 
 		 688 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  26.24 
 
 		 688 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  28.49 
 
 		 765 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  26.24 
 
 		 688 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  28.31 
 
 		 692 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  27.54 
 
 		 688 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  26.75 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  29.04 
 
 		 681 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  28.06 
 
 		 766 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  28.24 
 
 		 686 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  26.82 
 
 		 691 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  26.82 
 
 		 691 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  41.55 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  25 
 
 		 688 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  25.46 
 
 		 642 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  29.38 
 
 		 753 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  27.12 
 
 		 682 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  26.24 
 
 		 717 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  26.53 
 
 		 716 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  25.98 
 
 		 603 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  26.53 
 
 		 716 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  26.53 
 
 		 721 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  26.53 
 
 		 721 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  26.53 
 
 		 721 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  26.53 
 
 		 721 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  26.53 
 
 		 704 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  26.53 
 
 		 716 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>