232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0613 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  100 
 
 
539 aa  1077    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  45.59 
 
 
537 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  42.65 
 
 
555 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  44.13 
 
 
546 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  40.59 
 
 
596 aa  359  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  37.41 
 
 
554 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  39.01 
 
 
599 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  35.96 
 
 
585 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  39.42 
 
 
624 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  38.24 
 
 
611 aa  302  8.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  36.62 
 
 
617 aa  299  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  38.54 
 
 
585 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  35.77 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  38.69 
 
 
567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  35.44 
 
 
564 aa  266  7e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  36.06 
 
 
586 aa  259  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  36.51 
 
 
599 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  35.73 
 
 
590 aa  257  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  36.18 
 
 
561 aa  256  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  36.36 
 
 
573 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  33.03 
 
 
559 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  34.58 
 
 
555 aa  242  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  32.64 
 
 
688 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  32.26 
 
 
692 aa  240  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 
559 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  31.29 
 
 
688 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  32.97 
 
 
690 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  35.02 
 
 
642 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  33.21 
 
 
642 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  32.21 
 
 
686 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  31.29 
 
 
691 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  31.64 
 
 
701 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  32.71 
 
 
615 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  33.45 
 
 
688 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  34.11 
 
 
690 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  32.17 
 
 
691 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02026  carbon starvation protein A  31.75 
 
 
690 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 
688 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  34.03 
 
 
687 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 
688 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 
688 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  31.26 
 
 
696 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  32.47 
 
 
692 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  33.08 
 
 
687 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  34.03 
 
 
687 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  34.12 
 
 
685 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  33.77 
 
 
692 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  32.8 
 
 
696 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 
692 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 
692 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 
692 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  32.61 
 
 
753 aa  223  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  38.4 
 
 
684 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  33.52 
 
 
692 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  38.9 
 
 
687 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  40.29 
 
 
688 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  31.91 
 
 
691 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32.8 
 
 
692 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  33.22 
 
 
681 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  38.11 
 
 
684 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  40.29 
 
 
688 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  40.29 
 
 
688 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  32.29 
 
 
691 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  31.64 
 
 
614 aa  220  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1089  carbon starvation protein CstA  39.14 
 
 
717 aa  220  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  37.02 
 
 
701 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  31.08 
 
 
681 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 
613 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  37.02 
 
 
701 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  31.24 
 
 
647 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  32.04 
 
 
685 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  32.04 
 
 
685 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  39.94 
 
 
688 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  32.15 
 
 
690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  38.97 
 
 
688 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  37.02 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  40.34 
 
 
686 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  31.47 
 
 
589 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  38.67 
 
 
682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3226  carbon starvation protein CstA  38.86 
 
 
717 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00258818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  38.79 
 
 
692 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0958  carbon starvation protein CstA  38.57 
 
 
716 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  38.33 
 
 
684 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  33.08 
 
 
692 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  40.35 
 
 
688 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  39.43 
 
 
692 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  33.08 
 
 
692 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  39.43 
 
 
692 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  39.43 
 
 
692 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  30.89 
 
 
613 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  30.29 
 
 
606 aa  216  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0960  carbon starvation protein CstA  38.29 
 
 
715 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>