232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0148 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 596 aa  1185    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  41.02 
 
 		 539 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  42.2 
 
 		 567 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  35.98 
 
 		 555 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  39.29 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  33.78 
 
 		 537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 		 554 aa  263  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  31.93 
 
 		 585 aa  260  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  33.57 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  33.28 
 
 		 585 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  32.43 
 
 		 599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  32.97 
 
 		 617 aa  236  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  30.94 
 
 		 624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  32.54 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  30 
 
 		 703 aa  224  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  32.18 
 
 		 692 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  31.29 
 
 		 688 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  30.17 
 
 		 703 aa  223  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  30.31 
 
 		 703 aa  223  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  32.05 
 
 		 692 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  32.21 
 
 		 692 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  31.83 
 
 		 692 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  32.5 
 
 		 599 aa  220  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  31.74 
 
 		 686 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  31.88 
 
 		 692 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  31.71 
 
 		 692 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  31.88 
 
 		 692 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  31.88 
 
 		 692 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  31.26 
 
 		 686 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  31.67 
 
 		 692 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  31.91 
 
 		 586 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  30.92 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  31.5 
 
 		 688 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  31.5 
 
 		 688 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  31.5 
 
 		 688 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  31.62 
 
 		 692 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  31.91 
 
 		 688 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  31.28 
 
 		 589 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  31.62 
 
 		 692 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  31.62 
 
 		 692 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  31.61 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  31.71 
 
 		 685 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  32.72 
 
 		 685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  31.04 
 
 		 692 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  32.72 
 
 		 685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  31.11 
 
 		 687 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  32.11 
 
 		 690 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  31.54 
 
 		 684 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  31.42 
 
 		 688 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  31.4 
 
 		 687 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  30.1 
 
 		 606 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  31.42 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  30.96 
 
 		 691 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  31.4 
 
 		 687 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  31.22 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  32.99 
 
 		 615 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  31.49 
 
 		 688 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  31.89 
 
 		 685 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  30.87 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  31.69 
 
 		 684 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  31.49 
 
 		 688 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  31.71 
 
 		 686 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  31.42 
 
 		 688 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  33.72 
 
 		 695 aa  210  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  31.13 
 
 		 690 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  31.31 
 
 		 696 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  32.82 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  31.61 
 
 		 682 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  32.83 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  29.32 
 
 		 701 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  31.16 
 
 		 681 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  30.28 
 
 		 688 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  29.44 
 
 		 555 aa  206  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  29.77 
 
 		 690 aa  206  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  31.01 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  33.57 
 
 		 642 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  32.18 
 
 		 688 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  32.17 
 
 		 688 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  29.75 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  30.98 
 
 		 691 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  29.83 
 
 		 687 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  31.95 
 
 		 684 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  30.64 
 
 		 564 aa  203  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  30.2 
 
 		 691 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  31.25 
 
 		 559 aa  201  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  30.36 
 
 		 723 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  28.62 
 
 		 701 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  32.94 
 
 		 613 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  28.62 
 
 		 701 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  28.62 
 
 		 701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  28.62 
 
 		 701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  28.62 
 
 		 701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  30.52 
 
 		 559 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  28.62 
 
 		 701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  30.61 
 
 		 688 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  30.44 
 
 		 685 aa  200  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1089  carbon starvation protein CstA  29.29 
 
 		 717 aa  200  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  30.4 
 
 		 691 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  28.83 
 
 		 701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>