232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2948 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  87.38 
 
 		 642 aa  1100    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  56.71 
 
 		 647 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  58.48 
 
 		 615 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 642 aa  1260    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  62.13 
 
 		 606 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  58.05 
 
 		 589 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  53.66 
 
 		 615 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  53.8 
 
 		 603 aa  635  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  54.13 
 
 		 615 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  48.49 
 
 		 681 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  54.12 
 
 		 689 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  52.8 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  50.17 
 
 		 614 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  48.29 
 
 		 723 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  49.71 
 
 		 688 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  52.88 
 
 		 686 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  53.31 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  52.03 
 
 		 684 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3577  carbon starvation protein CstA  48.08 
 
 		 712 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0736186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  46.41 
 
 		 688 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  52.2 
 
 		 690 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  52.21 
 
 		 685 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  52.21 
 
 		 685 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  46.41 
 
 		 688 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  50.08 
 
 		 687 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  52.37 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 688 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  46.04 
 
 		 687 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  46.56 
 
 		 687 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  51.1 
 
 		 692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  51.27 
 
 		 692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  50.16 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  51.1 
 
 		 692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  52.8 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  50.42 
 
 		 738 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  50.93 
 
 		 692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  51.78 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  52.12 
 
 		 692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  51.78 
 
 		 688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  50.16 
 
 		 692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  51.1 
 
 		 692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  51.1 
 
 		 692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  54.56 
 
 		 613 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  52.73 
 
 		 685 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  45.21 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  45.21 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  51.27 
 
 		 692 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  45.36 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  50.76 
 
 		 692 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  45.21 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  45.21 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  45.66 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  50.76 
 
 		 692 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  50.76 
 
 		 692 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  51.53 
 
 		 684 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  52.2 
 
 		 686 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  45.51 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  52.13 
 
 		 688 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  49.83 
 
 		 686 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  49.16 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  49.16 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  49.16 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  49.16 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  49.16 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  46.26 
 
 		 701 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  51.53 
 
 		 690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  47.92 
 
 		 696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  45.74 
 
 		 685 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0334  carbon starvation protein CstA  49.03 
 
 		 740 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  44.55 
 
 		 688 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  51.44 
 
 		 687 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  47.38 
 
 		 690 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  51.1 
 
 		 691 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  50.25 
 
 		 696 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  50.59 
 
 		 739 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  53.23 
 
 		 613 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  48.64 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  46.41 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  50.59 
 
 		 682 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  51.43 
 
 		 745 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  47.24 
 
 		 707 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  48.91 
 
 		 707 aa  548  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  49.66 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  51.02 
 
 		 756 aa  545  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1363  carbon starvation protein CstA  51.28 
 
 		 705 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  50.6 
 
 		 703 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15010  carbon starvation protein, predicted membrane protein  47.89 
 
 		 762 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.273232  normal  0.768421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  51.01 
 
 		 688 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  50.94 
 
 		 703 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  47.21 
 
 		 695 aa  542  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  50.77 
 
 		 703 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  50.17 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  50.84 
 
 		 688 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  48.9 
 
 		 701 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  50.51 
 
 		 681 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  49.66 
 
 		 742 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  50.53 
 
 		 684 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  49.49 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>