232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2191 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  66.78 
 
 		 585 aa  756    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  77.47 
 
 		 586 aa  828    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 590 aa  1164    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  52.52 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  49.82 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  47.39 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  46.43 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  48.13 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  45.2 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  40.29 
 
 		 564 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  33.67 
 
 		 555 aa  312  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  35.29 
 
 		 537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  36.03 
 
 		 537 aa  293  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  34.13 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  37.28 
 
 		 539 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  36.35 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  33 
 
 		 703 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  32.76 
 
 		 617 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32.37 
 
 		 692 aa  259  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  33 
 
 		 703 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  32.83 
 
 		 703 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  33.86 
 
 		 611 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 692 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  32.7 
 
 		 688 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  32.65 
 
 		 624 aa  253  7e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  31.57 
 
 		 687 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  32.3 
 
 		 691 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  31.52 
 
 		 692 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  32.33 
 
 		 701 aa  251  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  31.01 
 
 		 692 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  32.2 
 
 		 687 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  31.13 
 
 		 690 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  30.83 
 
 		 692 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  31.01 
 
 		 692 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  33.68 
 
 		 692 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  32.01 
 
 		 688 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  31.54 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  30.79 
 
 		 691 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  32.4 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  33.92 
 
 		 585 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  31.01 
 
 		 692 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  31.01 
 
 		 692 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  31.01 
 
 		 692 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  31.01 
 
 		 692 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  32.37 
 
 		 691 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  31.08 
 
 		 692 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  31.08 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  32.44 
 
 		 687 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  31.08 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  31.77 
 
 		 686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  31.19 
 
 		 696 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  30.33 
 
 		 614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  31.79 
 
 		 688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 687 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  31.95 
 
 		 688 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  34.3 
 
 		 599 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  37.68 
 
 		 567 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  31.62 
 
 		 690 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  32.65 
 
 		 691 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  31.48 
 
 		 696 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  32.48 
 
 		 693 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  31.78 
 
 		 688 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 		 691 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02026  carbon starvation protein A  32.65 
 
 		 690 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  31.51 
 
 		 685 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  31.3 
 
 		 688 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  31.75 
 
 		 690 aa  241  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  32.03 
 
 		 688 aa  240  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  32.03 
 
 		 688 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  32.03 
 
 		 688 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  31.13 
 
 		 686 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  30.4 
 
 		 684 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  32.76 
 
 		 685 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  31.68 
 
 		 685 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  31.68 
 
 		 685 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  30.67 
 
 		 684 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  30.34 
 
 		 681 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  33.16 
 
 		 688 aa  237  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  31.79 
 
 		 704 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  31.79 
 
 		 716 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 716 aa  236  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04186  hypothetical protein  31.79 
 
 		 716 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 716 aa  236  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  31.62 
 
 		 716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  31.62 
 
 		 716 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  30.32 
 
 		 686 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  31.62 
 
 		 716 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  31.79 
 
 		 721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  31.79 
 
 		 721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  31.79 
 
 		 721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  31.79 
 
 		 721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  31.62 
 
 		 716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  31.62 
 
 		 716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  31.4 
 
 		 717 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0958  carbon starvation protein CstA  31.95 
 
 		 716 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  30.82 
 
 		 642 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  32.37 
 
 		 742 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>