232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2158 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  52.63 
 
 		 615 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  56.54 
 
 		 606 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 614 aa  1229    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  56.6 
 
 		 589 aa  648    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  52.52 
 
 		 615 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  50 
 
 		 603 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  51.72 
 
 		 615 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  55.78 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  49.6 
 
 		 647 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  50.17 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  48.81 
 
 		 603 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  48.81 
 
 		 603 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  48.64 
 
 		 603 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  48.94 
 
 		 681 aa  545  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  50.08 
 
 		 613 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  48.46 
 
 		 613 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  47.88 
 
 		 603 aa  538  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2095  carbon starvation protein CstA  46.59 
 
 		 604 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1085  carbon starvation protein CstA  47.39 
 
 		 605 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  47.27 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  47.27 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  47.27 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  48.85 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  46.91 
 
 		 692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  47.09 
 
 		 692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  46.38 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  47.1 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  46.74 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  46.56 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  46.74 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  46.77 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  48.15 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  46.74 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  46.74 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  46.74 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  47.18 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  47.45 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  49.12 
 
 		 689 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  44.01 
 
 		 695 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  48.15 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  46.41 
 
 		 688 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  46.48 
 
 		 690 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  46.23 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  46.41 
 
 		 688 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  47.62 
 
 		 687 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  47.12 
 
 		 685 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  46.21 
 
 		 686 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  45.95 
 
 		 687 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  44.73 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  45.95 
 
 		 687 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  46.91 
 
 		 684 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  46.13 
 
 		 686 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  41.95 
 
 		 738 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  46.49 
 
 		 685 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  46.38 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  44.05 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  46.03 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  46.49 
 
 		 685 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  44.8 
 
 		 688 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  46.74 
 
 		 690 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  45.61 
 
 		 686 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  45.79 
 
 		 685 aa  485  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  44.97 
 
 		 688 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  44.8 
 
 		 688 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  44.72 
 
 		 688 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  46.54 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  44.37 
 
 		 688 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  46.56 
 
 		 688 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  45.83 
 
 		 696 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  45.42 
 
 		 687 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  47.42 
 
 		 684 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  45.17 
 
 		 701 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  46.48 
 
 		 682 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0334  carbon starvation protein CstA  46.74 
 
 		 740 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  42.79 
 
 		 703 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  46.65 
 
 		 681 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5411  carbon starvation protein A  44.46 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  44.39 
 
 		 688 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5540  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5596  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3577  carbon starvation protein CstA  47.1 
 
 		 712 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0736186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  46.06 
 
 		 753 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  43.75 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5666  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.139081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5511  carbon starvation protein A  43.9 
 
 		 691 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  45.71 
 
 		 766 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  43.34 
 
 		 703 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  44.04 
 
 		 707 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  43.39 
 
 		 703 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  44.19 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  44.13 
 
 		 701 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0582  carbon starvation protein CstA  44.48 
 
 		 726 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  45.6 
 
 		 745 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  44.5 
 
 		 690 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  44.48 
 
 		 765 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  43.37 
 
 		 717 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  44.97 
 
 		 684 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>