232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2003 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 585 aa  1164    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  69.11 
 
 		 586 aa  739    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  66.78 
 
 		 590 aa  736    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  47.47 
 
 		 559 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  45.69 
 
 		 573 aa  462  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  47.75 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  49.16 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  48.12 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  44.68 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  42.62 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  36.16 
 
 		 537 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  35.88 
 
 		 555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  36.13 
 
 		 554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  41.27 
 
 		 539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  33.5 
 
 		 585 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  36.01 
 
 		 537 aa  292  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  36.09 
 
 		 617 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  37.14 
 
 		 611 aa  287  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  37.93 
 
 		 546 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  35.05 
 
 		 624 aa  272  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  34.13 
 
 		 692 aa  272  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  34.21 
 
 		 687 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  33.73 
 
 		 685 aa  266  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  33.73 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  34.34 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  33.96 
 
 		 692 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  33.73 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  33.73 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  33.79 
 
 		 692 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  34.34 
 
 		 692 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  34.34 
 
 		 692 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  34.2 
 
 		 688 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  34.25 
 
 		 691 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 		 692 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  34.2 
 
 		 688 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  33.11 
 
 		 685 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  33.51 
 
 		 688 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  33.11 
 
 		 685 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  34.4 
 
 		 692 aa  263  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  33.85 
 
 		 688 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  37.31 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  33.79 
 
 		 688 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  34.52 
 
 		 696 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  34.26 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  34.3 
 
 		 684 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  34.18 
 
 		 686 aa  259  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  33.22 
 
 		 686 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  32.94 
 
 		 687 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  32.77 
 
 		 687 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  34.62 
 
 		 687 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  32.77 
 
 		 688 aa  257  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  32.77 
 
 		 688 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  35.32 
 
 		 696 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  32.77 
 
 		 688 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  34.18 
 
 		 691 aa  256  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  32.6 
 
 		 688 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  32.94 
 
 		 690 aa  256  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  34.42 
 
 		 691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  31.92 
 
 		 642 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  33.75 
 
 		 684 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  33.28 
 
 		 688 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  33.45 
 
 		 692 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  33.5 
 
 		 688 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  33.56 
 
 		 691 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  33.12 
 
 		 690 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  33.68 
 
 		 688 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  33.28 
 
 		 701 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  32.26 
 
 		 690 aa  251  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  30.78 
 
 		 692 aa  250  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  31.92 
 
 		 686 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  32.64 
 
 		 688 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  34.81 
 
 		 596 aa  249  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  30.91 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  32.31 
 
 		 691 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  32.88 
 
 		 703 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  32.88 
 
 		 703 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  31.65 
 
 		 685 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  34.93 
 
 		 691 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02026  carbon starvation protein A  34.08 
 
 		 690 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  31.27 
 
 		 642 aa  246  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  32.88 
 
 		 703 aa  246  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  30.87 
 
 		 681 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  32.55 
 
 		 701 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 		 742 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  33.84 
 
 		 688 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  33.85 
 
 		 685 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  32.83 
 
 		 701 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  32.83 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  32.83 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  32.83 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  32.83 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  32.83 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  32.83 
 
 		 701 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  33.56 
 
 		 693 aa  240  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>