232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2230 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  100 
 
 
555 aa  1112    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  50.75 
 
 
537 aa  508  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  52.16 
 
 
546 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  43.08 
 
 
539 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  41.8 
 
 
599 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  36.65 
 
 
596 aa  349  7e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  37.7 
 
 
554 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  38.97 
 
 
617 aa  324  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  39.37 
 
 
624 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  36.44 
 
 
585 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  38.79 
 
 
537 aa  321  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  33.56 
 
 
573 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  35.38 
 
 
606 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  35.88 
 
 
585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  38.38 
 
 
611 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  33.72 
 
 
590 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  34.22 
 
 
586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  36.85 
 
 
564 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 
555 aa  294  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  34.3 
 
 
589 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  35.19 
 
 
561 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 
559 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  33.81 
 
 
559 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  35.62 
 
 
642 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  37.62 
 
 
567 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  34.95 
 
 
599 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  35.13 
 
 
642 aa  279  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  35.55 
 
 
692 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  35.41 
 
 
615 aa  277  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  34.53 
 
 
603 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  35.44 
 
 
691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  32.93 
 
 
686 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  33.8 
 
 
685 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  34.09 
 
 
701 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  33.62 
 
 
685 aa  273  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  35.12 
 
 
691 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  33.62 
 
 
685 aa  273  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  34.07 
 
 
688 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 
691 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  34.79 
 
 
696 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  33.68 
 
 
688 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  33.57 
 
 
688 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  33.57 
 
 
688 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  33.57 
 
 
688 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  34.7 
 
 
690 aa  267  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  33.28 
 
 
692 aa  267  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  33.63 
 
 
686 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 
692 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  33.84 
 
 
692 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  33.68 
 
 
692 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  34.32 
 
 
682 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  33.56 
 
 
692 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  33.56 
 
 
692 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  33.56 
 
 
692 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  33.63 
 
 
688 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  32.94 
 
 
692 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  32.94 
 
 
692 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  32.9 
 
 
613 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  32.99 
 
 
688 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  33.63 
 
 
688 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 
688 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  33.27 
 
 
684 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  34 
 
 
687 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  32.72 
 
 
692 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  32.72 
 
 
692 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  32.72 
 
 
692 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  33.1 
 
 
692 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  34.14 
 
 
692 aa  260  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  33.56 
 
 
615 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  32.59 
 
 
684 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  33.86 
 
 
687 aa  260  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  33.56 
 
 
688 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  33.5 
 
 
691 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  33.98 
 
 
696 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  32.02 
 
 
691 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  34.75 
 
 
647 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  32.46 
 
 
687 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  33.92 
 
 
686 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  32.43 
 
 
615 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  33.51 
 
 
691 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  33.28 
 
 
690 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  31.52 
 
 
681 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  33.68 
 
 
687 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  33.51 
 
 
690 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  33.74 
 
 
681 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  32.81 
 
 
688 aa  256  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  32.81 
 
 
688 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  32.81 
 
 
688 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 
688 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  40.78 
 
 
701 aa  253  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  41.34 
 
 
701 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  33.5 
 
 
742 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  41.34 
 
 
701 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  41.34 
 
 
701 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  41.34 
 
 
701 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 
684 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  41.34 
 
 
701 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  40.95 
 
 
701 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  41.34 
 
 
701 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  40.95 
 
 
701 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>