232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  100 
 
 		 599 aa  1189    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  48.62 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  43.75 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  41.8 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  39.1 
 
 		 539 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  35.56 
 
 		 554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  37.46 
 
 		 585 aa  306  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  37.9 
 
 		 611 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  35.97 
 
 		 567 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  37.48 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  33.96 
 
 		 537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  34.97 
 
 		 564 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  34.27 
 
 		 585 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  35.54 
 
 		 624 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  33.85 
 
 		 596 aa  260  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  34.27 
 
 		 573 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  31.99 
 
 		 590 aa  252  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  33.04 
 
 		 559 aa  250  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  34.12 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  32.92 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  33.45 
 
 		 561 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  30.26 
 
 		 686 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  33.05 
 
 		 599 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  31.67 
 
 		 642 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  32.24 
 
 		 615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  31.84 
 
 		 642 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 		 606 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  31.58 
 
 		 691 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  31.54 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  29.9 
 
 		 692 aa  229  9e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  31.38 
 
 		 647 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  29.61 
 
 		 684 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  32.39 
 
 		 696 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  31.25 
 
 		 589 aa  228  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  33.06 
 
 		 692 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  32.07 
 
 		 688 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  30.88 
 
 		 692 aa  227  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  33.12 
 
 		 692 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  31.68 
 
 		 723 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 		 692 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  31.44 
 
 		 701 aa  224  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  30.9 
 
 		 742 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  32.56 
 
 		 703 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  32.26 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  32.68 
 
 		 692 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  32.68 
 
 		 692 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 		 692 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 		 692 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 		 692 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 		 692 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  32.68 
 
 		 692 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  32.79 
 
 		 692 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32.47 
 
 		 692 aa  223  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  32.24 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  32.24 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  31.77 
 
 		 701 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  32.24 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  32.24 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  32.24 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  31.91 
 
 		 701 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  30.69 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  31.91 
 
 		 701 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  31.29 
 
 		 687 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  30.25 
 
 		 691 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  29.79 
 
 		 681 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  31.7 
 
 		 690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  31.69 
 
 		 684 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  30.03 
 
 		 690 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  30.82 
 
 		 766 aa  220  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  31.4 
 
 		 688 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  32.36 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  32.18 
 
 		 686 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  32.07 
 
 		 703 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  32.28 
 
 		 695 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  32.07 
 
 		 703 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  30.13 
 
 		 686 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  30.36 
 
 		 688 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  31.84 
 
 		 615 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  30.86 
 
 		 687 aa  216  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  32.01 
 
 		 681 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  31.74 
 
 		 753 aa  216  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  30.95 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  29.5 
 
 		 688 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3577  carbon starvation protein CstA  31 
 
 		 712 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0736186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  29.67 
 
 		 765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  30.47 
 
 		 603 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  30.08 
 
 		 688 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  30.08 
 
 		 688 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  30.08 
 
 		 688 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  29.93 
 
 		 688 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  30.81 
 
 		 685 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  30.86 
 
 		 739 aa  212  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  29.45 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  29.58 
 
 		 691 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  31.19 
 
 		 701 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  29.43 
 
 		 688 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>