227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3580 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  72.97 
 
 		 647 aa  938    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  78.7 
 
 		 615 aa  971    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  58.28 
 
 		 606 aa  703    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  57.05 
 
 		 589 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 615 aa  1226    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  71.97 
 
 		 603 aa  877    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  60.1 
 
 		 613 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  86.5 
 
 		 615 aa  1086    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  62.34 
 
 		 613 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  54.03 
 
 		 642 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  54.13 
 
 		 642 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  51.72 
 
 		 614 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  50.63 
 
 		 691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  47.95 
 
 		 603 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  52.67 
 
 		 692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  53.71 
 
 		 687 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  47.95 
 
 		 603 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  51.62 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  52.92 
 
 		 692 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  47.95 
 
 		 603 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  52.57 
 
 		 692 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  52.57 
 
 		 692 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  52.74 
 
 		 692 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  52.74 
 
 		 692 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  52.83 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  52.74 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  53.89 
 
 		 681 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  52.82 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  52.57 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  52.39 
 
 		 692 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  52.64 
 
 		 692 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  52.21 
 
 		 681 aa  549  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  52.64 
 
 		 692 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  52.64 
 
 		 692 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  52.47 
 
 		 696 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  51.76 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  52.3 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  52.47 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  51.09 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  48.74 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  52.85 
 
 		 696 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  50 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  52.82 
 
 		 685 aa  545  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  51.94 
 
 		 687 aa  544  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  51.22 
 
 		 703 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  52.82 
 
 		 685 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  51.05 
 
 		 703 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  50.7 
 
 		 703 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  50.18 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  51.42 
 
 		 684 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  52.04 
 
 		 688 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  50.54 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  53.64 
 
 		 723 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  50 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  51.23 
 
 		 690 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  51.16 
 
 		 738 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5411  carbon starvation protein A  49.55 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  51.25 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  50.6 
 
 		 686 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  51.49 
 
 		 689 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5540  carbon starvation protein A  50.63 
 
 		 691 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  50.62 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  49.65 
 
 		 687 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  52.11 
 
 		 684 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  49.38 
 
 		 687 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  50.26 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  50.27 
 
 		 688 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  50.27 
 
 		 688 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  49.47 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  50.26 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  49.91 
 
 		 701 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1085  carbon starvation protein CstA  48.41 
 
 		 605 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  50.26 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  50.26 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  50.17 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  50.26 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  50.26 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  50.27 
 
 		 688 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  50.31 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  50.16 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  50.16 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  50.31 
 
 		 691 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  51.25 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5666  carbon starvation protein A  50.16 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.139081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  49.29 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5596  carbon starvation protein A  50.31 
 
 		 691 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5511  carbon starvation protein A  50.16 
 
 		 691 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  49.74 
 
 		 701 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  49.29 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  49.29 
 
 		 688 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  51.06 
 
 		 684 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  48.67 
 
 		 690 aa  525  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  51.44 
 
 		 693 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  51.25 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  49.12 
 
 		 688 aa  525  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  49.19 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>