232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0268 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  99.83 
 
 		 603 aa  1214    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2095  carbon starvation protein CstA  76.23 
 
 		 604 aa  897    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  80.17 
 
 		 603 aa  952    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1085  carbon starvation protein CstA  76.2 
 
 		 605 aa  929    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 603 aa  1214    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  99.83 
 
 		 603 aa  1214    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  49 
 
 		 606 aa  574  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  49 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  48.24 
 
 		 615 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  50.84 
 
 		 589 aa  569  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  48.64 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  48.63 
 
 		 603 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  47.95 
 
 		 615 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  45.74 
 
 		 647 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  46.87 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  46.96 
 
 		 642 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  51.08 
 
 		 613 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  46.27 
 
 		 613 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  44.56 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  45.68 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  44.84 
 
 		 681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  42.05 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  44.4 
 
 		 691 aa  452  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  42.98 
 
 		 692 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  45.05 
 
 		 689 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  40.99 
 
 		 695 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  43.16 
 
 		 692 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  44.82 
 
 		 692 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  42.86 
 
 		 692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  43.41 
 
 		 688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  43.04 
 
 		 692 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  43.41 
 
 		 687 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  43.19 
 
 		 696 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  43.04 
 
 		 692 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  43.06 
 
 		 687 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  43.21 
 
 		 692 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  42.93 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  43.04 
 
 		 692 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  42.93 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  43.04 
 
 		 692 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  42.88 
 
 		 690 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  42.76 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  45.07 
 
 		 703 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  42.68 
 
 		 692 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  41.99 
 
 		 692 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  42.76 
 
 		 688 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  41.99 
 
 		 692 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  43.65 
 
 		 685 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  43.54 
 
 		 687 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  41.99 
 
 		 692 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  41.99 
 
 		 692 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  45.98 
 
 		 723 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  42.96 
 
 		 696 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  43.27 
 
 		 688 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  43.45 
 
 		 684 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  43.06 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  43.67 
 
 		 690 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  43.48 
 
 		 690 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  44.54 
 
 		 703 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  44.37 
 
 		 703 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  44.01 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  42.96 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5411  carbon starvation protein A  41.19 
 
 		 692 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  39.68 
 
 		 738 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  43.49 
 
 		 688 aa  432  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  44.11 
 
 		 684 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  43.39 
 
 		 685 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  43.26 
 
 		 681 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  42.27 
 
 		 686 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  40.65 
 
 		 707 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5540  carbon starvation protein A  42.39 
 
 		 691 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  42.13 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  42.23 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  42.07 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  40.58 
 
 		 753 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  42.07 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  42.23 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  42.13 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5666  carbon starvation protein A  42.07 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.139081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  43.21 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  42.13 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5511  carbon starvation protein A  42.07 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  43.21 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  41.59 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  42.25 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  42.13 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  42.25 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  42.25 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  42.25 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  42.25 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  42.13 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5596  carbon starvation protein A  42.07 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  42.13 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  42.68 
 
 		 682 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  41.24 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  42.08 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  43.59 
 
 		 766 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  41.24 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  41.24 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0582  carbon starvation protein CstA  41.03 
 
 		 726 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>