232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2017 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  56.02 
 
 		 716 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  61.29 
 
 		 701 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  55.87 
 
 		 716 aa  799    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  61.29 
 
 		 701 aa  856    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  62.21 
 
 		 688 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  56.02 
 
 		 721 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  53.7 
 
 		 691 aa  716    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  64.4 
 
 		 686 aa  914    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  808    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  55.48 
 
 		 703 aa  762    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  63.57 
 
 		 685 aa  898    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  56.45 
 
 		 703 aa  767    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  61.93 
 
 		 691 aa  868    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  56.02 
 
 		 721 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  807    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 688 aa  1379    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  807    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  806    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  61.63 
 
 		 691 aa  881    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  64.55 
 
 		 692 aa  909    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  55.44 
 
 		 716 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  53.45 
 
 		 695 aa  688    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  64.84 
 
 		 690 aa  906    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  64.25 
 
 		 692 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  62.2 
 
 		 688 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  64.99 
 
 		 692 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  56.02 
 
 		 721 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  61.58 
 
 		 701 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5596  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  806    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  64.84 
 
 		 692 aa  924    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  61.29 
 
 		 701 aa  856    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5666  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  807    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.139081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  63.72 
 
 		 690 aa  873    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  66.27 
 
 		 681 aa  885    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  61.58 
 
 		 701 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  55.59 
 
 		 716 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  64.4 
 
 		 692 aa  905    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  51.52 
 
 		 756 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  64.12 
 
 		 686 aa  928    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  61.63 
 
 		 693 aa  833    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  62.07 
 
 		 696 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  53.8 
 
 		 689 aa  724    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  61.58 
 
 		 701 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  61.63 
 
 		 696 aa  860    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  61.58 
 
 		 701 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  61 
 
 		 701 aa  846    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  65.58 
 
 		 691 aa  902    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  52.9 
 
 		 681 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  64.99 
 
 		 692 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1798  carbon starvation protein CstA  52.05 
 
 		 764 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  55.04 
 
 		 707 aa  735    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  90.79 
 
 		 685 aa  1256    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  62.21 
 
 		 688 aa  867    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  61.29 
 
 		 701 aa  856    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0582  carbon starvation protein CstA  56.03 
 
 		 726 aa  798    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 688 aa  1379    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  62.21 
 
 		 688 aa  886    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  62.72 
 
 		 691 aa  864    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  61.58 
 
 		 701 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  56.02 
 
 		 721 aa  800    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  99.85 
 
 		 688 aa  1377    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  56.02 
 
 		 716 aa  801    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  64.7 
 
 		 692 aa  924    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  62.21 
 
 		 688 aa  865    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5540  carbon starvation protein A  61.84 
 
 		 691 aa  809    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1363  carbon starvation protein CstA  60.53 
 
 		 705 aa  807    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  54.67 
 
 		 766 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  64.99 
 
 		 692 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  64.11 
 
 		 686 aa  873    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  63.72 
 
 		 692 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  61.29 
 
 		 701 aa  856    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  57.36 
 
 		 692 aa  793    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  55.44 
 
 		 716 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  61.29 
 
 		 701 aa  855    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1845  carbon starvation protein CstA  52.05 
 
 		 764 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2024  carbon starvation protein CstA  50.65 
 
 		 767 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  65.34 
 
 		 685 aa  894    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  55.34 
 
 		 738 aa  757    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  64.19 
 
 		 687 aa  918    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  55.76 
 
 		 703 aa  766    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  64.25 
 
 		 684 aa  885    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  64.4 
 
 		 688 aa  890    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  55.16 
 
 		 716 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  65.92 
 
 		 687 aa  863    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  64.25 
 
 		 692 aa  903    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1779  carbon starvation protein CstA  52.05 
 
 		 764 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  64.25 
 
 		 692 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  55.95 
 
 		 704 aa  799    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  55.69 
 
 		 742 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4322  carbon starvation protein CstA  50.51 
 
 		 768 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  64.99 
 
 		 692 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  55.86 
 
 		 717 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  61.05 
 
 		 701 aa  857    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  64.99 
 
 		 692 aa  929    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  62.06 
 
 		 688 aa  889    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  63.3 
 
 		 691 aa  835    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  55.59 
 
 		 716 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  59.34 
 
 		 682 aa  826    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  61.62 
 
 		 684 aa  811    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  62.21 
 
 		 688 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>