232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1389 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  100 
 
 		 599 aa  1164    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  48.95 
 
 		 590 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  48.58 
 
 		 586 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  47.34 
 
 		 585 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  46.47 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  45.39 
 
 		 555 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  47.68 
 
 		 573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  48.75 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  47.75 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  39.53 
 
 		 564 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  37.34 
 
 		 554 aa  317  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 		 555 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  35.68 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  38.75 
 
 		 546 aa  299  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  37.12 
 
 		 611 aa  294  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  37.97 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  38.31 
 
 		 539 aa  277  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  34.32 
 
 		 537 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  32.52 
 
 		 585 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  35.35 
 
 		 624 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  32.26 
 
 		 692 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  32.54 
 
 		 614 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 		 688 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32.62 
 
 		 692 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 		 688 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 		 688 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  32.75 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  31.73 
 
 		 615 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  32.75 
 
 		 692 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 		 688 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  31.67 
 
 		 687 aa  246  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  32.92 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  31.63 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  31.97 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  32.56 
 
 		 696 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  31.63 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  31.63 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  32.76 
 
 		 688 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  32.38 
 
 		 688 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  33.8 
 
 		 681 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 692 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 692 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 692 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  31.37 
 
 		 692 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  31.9 
 
 		 642 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  32.31 
 
 		 606 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  31.67 
 
 		 696 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  32.57 
 
 		 685 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  31.81 
 
 		 686 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  33.21 
 
 		 685 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  32.62 
 
 		 599 aa  239  8e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  31.86 
 
 		 615 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  31.63 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  31.68 
 
 		 687 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  33.45 
 
 		 684 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  32.27 
 
 		 589 aa  238  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  33.97 
 
 		 567 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  32.97 
 
 		 647 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  32.32 
 
 		 686 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  32.04 
 
 		 688 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  31.81 
 
 		 691 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  31.56 
 
 		 716 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  31.7 
 
 		 615 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 		 684 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  31.56 
 
 		 716 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  31.56 
 
 		 716 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  32.09 
 
 		 596 aa  234  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  31.87 
 
 		 688 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  31.56 
 
 		 716 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  31.56 
 
 		 716 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  31.7 
 
 		 642 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  32.98 
 
 		 684 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  31.8 
 
 		 721 aa  233  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  31.8 
 
 		 721 aa  233  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  31.8 
 
 		 721 aa  233  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  31.8 
 
 		 721 aa  233  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  32.55 
 
 		 691 aa  232  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  31.25 
 
 		 685 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  31.91 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  31.25 
 
 		 685 aa  233  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  32.7 
 
 		 688 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  30.78 
 
 		 603 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  31.79 
 
 		 701 aa  231  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  31.22 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  31.22 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  32.86 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  31.22 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  31.22 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  31.22 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  31.22 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  31.42 
 
 		 745 aa  230  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  32.36 
 
 		 703 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  31.33 
 
 		 690 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  32.46 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>