232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0113 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 564 aa  1115    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  40.07 
 
 		 585 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  41.52 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  40.55 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  38.63 
 
 		 590 aa  363  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  38.46 
 
 		 586 aa  363  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  37.61 
 
 		 573 aa  363  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  38.73 
 
 		 559 aa  360  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  39.63 
 
 		 559 aa  356  6.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  37.5 
 
 		 555 aa  353  7e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  38.22 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  37.36 
 
 		 555 aa  324  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  37.09 
 
 		 554 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  37.64 
 
 		 546 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  34.69 
 
 		 585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  36.29 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  33.45 
 
 		 537 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  35.14 
 
 		 624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  34.2 
 
 		 599 aa  270  7e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  34.57 
 
 		 617 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  33.51 
 
 		 692 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 		 723 aa  259  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  34.19 
 
 		 611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  34.14 
 
 		 692 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  31.86 
 
 		 606 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  31.77 
 
 		 589 aa  253  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  33.22 
 
 		 688 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  32.87 
 
 		 688 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  32.57 
 
 		 687 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  32.57 
 
 		 687 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  33.27 
 
 		 691 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  31.11 
 
 		 703 aa  246  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  32.4 
 
 		 701 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32.46 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  32.98 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  31.83 
 
 		 615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  33.45 
 
 		 642 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  33.39 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 		 692 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 692 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 		 692 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 		 692 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  33.22 
 
 		 692 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  33.22 
 
 		 692 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  33.22 
 
 		 692 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  32.98 
 
 		 692 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  32.92 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  32.98 
 
 		 684 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  34.05 
 
 		 765 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 688 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  32.81 
 
 		 692 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  30.77 
 
 		 703 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 688 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 688 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2158  carbon starvation protein CstA  32.08 
 
 		 614 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00428964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  32.16 
 
 		 739 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  30.63 
 
 		 703 aa  240  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  32.5 
 
 		 686 aa  240  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  32.7 
 
 		 687 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  33.1 
 
 		 688 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  32.46 
 
 		 692 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  32.25 
 
 		 615 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  32.7 
 
 		 690 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  33.1 
 
 		 688 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  33.27 
 
 		 766 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  32.25 
 
 		 642 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  32.1 
 
 		 753 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  31.55 
 
 		 701 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  31.55 
 
 		 701 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0958  carbon starvation protein CstA  32.01 
 
 		 716 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  31.55 
 
 		 701 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  31.55 
 
 		 701 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  32.34 
 
 		 692 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  31.55 
 
 		 701 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  32.14 
 
 		 613 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  31.79 
 
 		 688 aa  236  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  31.65 
 
 		 647 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  31.55 
 
 		 701 aa  236  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  32 
 
 		 696 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  32.7 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0960  carbon starvation protein CstA  31.66 
 
 		 715 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444531  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  31.38 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  30.65 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  31.38 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  32.57 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  31.38 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  31.38 
 
 		 701 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  31.03 
 
 		 603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  31.38 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  31.38 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3105  carbon starvation protein CstA  31.47 
 
 		 756 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  31.14 
 
 		 717 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  31.14 
 
 		 716 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13080  carbon starvation protein A cstA  33.16 
 
 		 758 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.585892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04186  hypothetical protein  31.14 
 
 		 716 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  31.14 
 
 		 716 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  31.14 
 
 		 721 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>