232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10430 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  100 
 
 
554 aa  1097    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  43.27 
 
 
537 aa  415  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  37.23 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  37.55 
 
 
539 aa  339  8e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  40.68 
 
 
546 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  37.7 
 
 
555 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  36.7 
 
 
555 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  37.77 
 
 
559 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  39.47 
 
 
559 aa  319  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  35.73 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  34.72 
 
 
585 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  36.96 
 
 
564 aa  296  5e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  37.19 
 
 
573 aa  296  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  36.83 
 
 
599 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  35.86 
 
 
585 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  34.31 
 
 
624 aa  286  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  33.96 
 
 
611 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  33.06 
 
 
617 aa  279  8e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  35.56 
 
 
599 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  35.15 
 
 
688 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  34.93 
 
 
692 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  34.62 
 
 
688 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  34.97 
 
 
688 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  34.42 
 
 
691 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  34.87 
 
 
692 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  34.87 
 
 
692 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  34.87 
 
 
692 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  34.8 
 
 
688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  34.75 
 
 
692 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  33.92 
 
 
685 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  33.51 
 
 
586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  34.8 
 
 
688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  35.3 
 
 
692 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  34.56 
 
 
688 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  34.57 
 
 
692 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  34.22 
 
 
692 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  34.22 
 
 
692 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  35.08 
 
 
684 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  33.44 
 
 
685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  34.93 
 
 
692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  33.1 
 
 
696 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  33.44 
 
 
685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  34.21 
 
 
688 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  34.78 
 
 
686 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 
692 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 
692 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 
692 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  32.81 
 
 
688 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  33.79 
 
 
590 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  34.32 
 
 
687 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  35.14 
 
 
688 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 
687 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  34.46 
 
 
686 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  34.22 
 
 
753 aa  263  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  35.39 
 
 
681 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  34.93 
 
 
686 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  33.04 
 
 
681 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  33.93 
 
 
691 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  32.8 
 
 
691 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  31.71 
 
 
696 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  35.64 
 
 
567 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  34.68 
 
 
688 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  35.14 
 
 
684 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  34.28 
 
 
765 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  34.43 
 
 
596 aa  259  9e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  32.62 
 
 
690 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  32.51 
 
 
690 aa  258  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  33 
 
 
685 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  34 
 
 
692 aa  256  8e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  34.16 
 
 
766 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  32.84 
 
 
687 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  33.33 
 
 
701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  32.56 
 
 
685 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0960  carbon starvation protein CstA  32.76 
 
 
715 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  33.04 
 
 
701 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  33.04 
 
 
701 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  33.04 
 
 
701 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  33.04 
 
 
701 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  33.04 
 
 
701 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  32.5 
 
 
687 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  32.81 
 
 
701 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  32.98 
 
 
701 aa  253  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  32.81 
 
 
701 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  32.81 
 
 
701 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  32.81 
 
 
701 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  32.81 
 
 
701 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  35.45 
 
 
642 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  32.81 
 
 
701 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  32.01 
 
 
688 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  32.01 
 
 
688 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  32.01 
 
 
688 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0958  carbon starvation protein CstA  31.66 
 
 
716 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  31.78 
 
 
691 aa  250  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  32.28 
 
 
688 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3361  carbon starvation protein CstA  34.22 
 
 
765 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  33.46 
 
 
642 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  33.57 
 
 
690 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  36.38 
 
 
693 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  33.63 
 
 
707 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  33.03 
 
 
738 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.121526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>