232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0741 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 483 aa  966    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  97.72 
 
 		 483 aa  905    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  62.9 
 
 		 472 aa  579  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  57.14 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  64.52 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  57.32 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  54.43 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  53.32 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  53.59 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  53.78 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  53.57 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  55.95 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  53.57 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  53.57 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  52.8 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  52.16 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  52.04 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  52.15 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  51.73 
 
 		 494 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  52.04 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  49.9 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  53.56 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  53.56 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  50.3 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  53.56 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  50.2 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  53.77 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  53.56 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  50.61 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  50.72 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  53.49 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  53.49 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  55.86 
 
 		 472 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  52.24 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  45.83 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  47.76 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  49.13 
 
 		 467 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  56.74 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  43.99 
 
 		 491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  43.92 
 
 		 489 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  44.24 
 
 		 491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  47.28 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  44.24 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  42.89 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  42.89 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  43.7 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  44.33 
 
 		 487 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  42.89 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  42.89 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  43.09 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  41.21 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  28.44 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  27.72 
 
 		 537 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  30.12 
 
 		 546 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  29.08 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.29 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.65 
 
 		 559 aa  140  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.45 
 
 		 559 aa  136  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  26.43 
 
 		 599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  28.06 
 
 		 555 aa  130  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  26.59 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27.2 
 
 		 561 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.91 
 
 		 573 aa  116  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  25.56 
 
 		 539 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  31.09 
 
 		 692 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  29.97 
 
 		 684 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  29.97 
 
 		 684 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  28.53 
 
 		 723 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  41.94 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  28.06 
 
 		 688 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  27.7 
 
 		 537 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  24.83 
 
 		 603 aa  100  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  28.36 
 
 		 688 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  28.36 
 
 		 688 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  24.04 
 
 		 687 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  28.01 
 
 		 686 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  27.78 
 
 		 688 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  28.07 
 
 		 688 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  30.03 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  30.03 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  40.43 
 
 		 599 aa  97.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  26.16 
 
 		 647 aa  96.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  27.19 
 
 		 691 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  27.19 
 
 		 691 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  26.96 
 
 		 688 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  27.71 
 
 		 696 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  30.03 
 
 		 603 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  38.85 
 
 		 624 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3105  carbon starvation protein CstA  26.12 
 
 		 756 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0646  carbon starvation protein  27.15 
 
 		 799 aa  94.4  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.241278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  24.78 
 
 		 701 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  30 
 
 		 615 aa  93.2  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  27.83 
 
 		 717 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  27.54 
 
 		 716 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  28.31 
 
 		 691 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  27.54 
 
 		 716 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  27.54 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  26.8 
 
 		 615 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  24.73 
 
 		 701 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  27.83 
 
 		 716 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>