232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0772 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  83.88 
 
 		 490 aa  840    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  80.58 
 
 		 487 aa  793    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  87.45 
 
 		 491 aa  886    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  87.45 
 
 		 491 aa  886    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 489 aa  978    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  88.22 
 
 		 490 aa  884    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  87.24 
 
 		 491 aa  885    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  88.64 
 
 		 490 aa  885    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  88.43 
 
 		 490 aa  885    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  88.43 
 
 		 490 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  88.45 
 
 		 490 aa  889    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  46.92 
 
 		 470 aa  422  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  47.13 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  47.61 
 
 		 489 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  45.19 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  44.65 
 
 		 478 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  46.75 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  45.74 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  46.61 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  44.24 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  45.88 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  45.08 
 
 		 482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  46.79 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  44.33 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  44.03 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  45.09 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  45.94 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  45.13 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  43.97 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  43.92 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  44.12 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  43.97 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  43.97 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  45.11 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  43.61 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  43.96 
 
 		 472 aa  385  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  45.15 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  46.07 
 
 		 467 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  44.62 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  44.12 
 
 		 480 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  44.12 
 
 		 480 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  44.12 
 
 		 480 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  48.54 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  43.92 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  43.92 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  39.91 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  36.81 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  34.1 
 
 		 484 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  29.05 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  26.04 
 
 		 537 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.69 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  27.99 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  26.86 
 
 		 696 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  27.65 
 
 		 599 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  27.4 
 
 		 696 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  25.44 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  25.44 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  25.44 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  26.88 
 
 		 559 aa  114  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  25.62 
 
 		 692 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  25.62 
 
 		 692 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  25.62 
 
 		 692 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  25.62 
 
 		 692 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  26 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  26.88 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  24.75 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  25.09 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  27.6 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  27.22 
 
 		 687 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  25.89 
 
 		 688 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  26.39 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  26.65 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  28.33 
 
 		 688 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  28.26 
 
 		 691 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  25.89 
 
 		 688 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  28.45 
 
 		 690 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  29.24 
 
 		 687 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  23.89 
 
 		 685 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  25.89 
 
 		 688 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  25.31 
 
 		 701 aa  107  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  26.67 
 
 		 692 aa  106  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  26.67 
 
 		 687 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  25.45 
 
 		 703 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  25.45 
 
 		 703 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  25.61 
 
 		 555 aa  103  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  24.56 
 
 		 691 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.16 
 
 		 753 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  25.63 
 
 		 703 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  26.32 
 
 		 756 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  25.78 
 
 		 765 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  25.27 
 
 		 682 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  26.42 
 
 		 688 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  24.47 
 
 		 691 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  23.93 
 
 		 688 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  26.96 
 
 		 766 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  25.05 
 
 		 573 aa  97.1  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  23.75 
 
 		 688 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>