232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0012 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  100 
 
 		 484 aa  959    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  58.28 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  57.98 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  58.19 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  55.1 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  50.92 
 
 		 478 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  54.29 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  52.32 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  53.26 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  50.41 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  50.31 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  53.08 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  54.31 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  54.31 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  50.21 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  51.63 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  49.4 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  50.31 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  53.08 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  53.99 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  52.39 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  52.16 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  50.94 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  50.4 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  49.48 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  49.48 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  49.48 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  53.21 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  56.69 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  47.64 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  50.31 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  50.31 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  50.31 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  49.9 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  49.9 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  52.37 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  54.27 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  45.81 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  45.81 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  45.81 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  45.81 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  45.15 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  45.4 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 490 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  45.38 
 
 		 487 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  43.16 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  44.74 
 
 		 490 aa  364  2e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  41.6 
 
 		 484 aa  329  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  29.32 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.43 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  28.97 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  26.69 
 
 		 599 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  25.77 
 
 		 559 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  26.1 
 
 		 559 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  27.51 
 
 		 564 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  25.78 
 
 		 539 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  27.82 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  26.42 
 
 		 555 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  27.29 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  26.77 
 
 		 537 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27.05 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  25.58 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  25.58 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  25.58 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  25.58 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  25.35 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  25.58 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  26.52 
 
 		 606 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  25.49 
 
 		 701 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  27.94 
 
 		 603 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  27.94 
 
 		 603 aa  90.5  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  25.91 
 
 		 692 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  27.94 
 
 		 603 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  24.69 
 
 		 701 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  24.69 
 
 		 701 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  24.69 
 
 		 701 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  24.69 
 
 		 701 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  24.69 
 
 		 701 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0860  carbon starvation protein CstA  28.48 
 
 		 591 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.983517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  28.49 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  29.15 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  29.15 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  29.15 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  26.86 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0894  carbon starvation protein CstA  28.26 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  26.02 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  29.15 
 
 		 585 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  29.34 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  28.36 
 
 		 688 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2095  carbon starvation protein CstA  26 
 
 		 604 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  28.81 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0448  carbon starvation protein CstA  27.53 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000722986  hitchhiker  0.00131941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1085  carbon starvation protein CstA  26.14 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  24.95 
 
 		 696 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  27.09 
 
 		 692 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  28.62 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  25.47 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>